C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
N
C12N 15/12 (2006.01) C07K 14/47 (2006.01) C07K 14/705 (2006.01) C12N 15/63 (2006.01) C12Q 1/00 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01)
Patent
CA 2470325
The invention provides a method for diagnosing Inflammatory Bowel Diseases, using genetic markers that are implicated in severe, early-onset Crohn's Disease (CD). The invention also provides coding sequence mutations in the OCTN1 gene that significantly reduces its ability to transport the organic cation carnitine. The invention further provides mutations in the promoter region OCTN2 that downregulates both basal transcription and transcription induced either by heat shock or arachidonic acid. This transcription difference is apparently due to the disruption of a binding site for heat shock transcription factor 1 (HSF1). A haplotype of two mutations is found in Crohn's Disease (CD) patients. Together, these mutations reduce cellular ability to respond to metabolic stress in inflamed tissue and may further be involved in the clearance of toxic substances from cells. The invention provides for the identification and use of these polynucleotides and encoded polypeptide sequences as targets for the development of therapeutic compounds intended to be useful in the treatment of Inflammatory Bowel Diseases and inflammation generally.
L'invention concerne une méthode de diagnostic de maladies intestinales inflammatoires, faisant intervenir des marqueurs génétiques liés à la maladie de Crohn aiguë à début précoce. L'invention concerne également des mutations de séquences codantes dans le gène de OCTN1 qui réduisent sensiblement sa capacité à transporter le cation organique de la carnitine. L'invention concerne également des mutations dans la région du promoteur de OCTN2 qui réduit la transcription de base et la transcription induite par un choc thermique ou par l'acide arachidonique. Cette différence de transcription semble être due à l'interruption d'un site de liaison du facteur de transcription 1 (HSF1) par le choc thermique. On trouve un haplotype de deux mutations chez des patients atteints de la maladie de Crohn. Par ailleurs, ces mutations réduisent la capacité des cellules à réagir au stress métabolique dans des tissus enflammés et peuvent également être liées à l'élimination de substances toxiques dans des cellules. L'invention concerne également l'identification et l'utilisation de ces polynucléotides et de séquences polypeptidiques codées, comme cibles dans l'élaboration de composés thérapeutiques destinés au traitement de maladies intestinales inflammatoires et, plus globalement, au traitement d'inflammations.
Peltekova Vanya D.
Rubin Laurence A.
Siminovitch Katherine A.
St. George-Hyslop Peter H.
Wintle Richard F.
Ellipsis Biotherapeutics Corporation
Smart & Biggar
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1961827