Polypeptide libraries with a predetermined scaffold

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – K

Patent

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C07K 1/04 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01)

Patent

CA 2710140

Populations of polypeptide variants based on a common scaffold, each polypeptide in the population comprising the scaffold amino acid sequence EXXXAXXEIX XLPNLTXXQX XAFIXKLXDD PSQSSELLSE AKKLNDSQ or AKYAKEXXXAXX EIXXLPNLTX XQXXAFIXKL XDDPSQSSEL LSEAKKLNDS Q, wherein each X individually corresponds to an amino acid residue which is varied in the population are disclosed. Also populations of polynucleotides, wherein each member encodes a member of a polypeptide population are disclosed. Furthermore, combinations of such polypeptide populations and such polynucleotide populations are disclosed, wherein each member of polypeptide population is physically or spatially associated with the polynucleotide encoding that member via means for genotype-phenotype coupling. Furthermore, methods for selecting a desired polypeptide having an affinity for a predetermined target from a population of polypeptides, isolation of a polynucleotide encoding a desired polypeptide having an affinity for a predetermined target, identifying a desired polypeptide having an affinity for a predetermined target, selecting and identifying a desired polypeptide having affinity for a predetermined target, and production of a desired polypeptide having an affinity for a predetermined target are disclosed.

L'invention concerne des populations de variants de polypeptides basés sur une structure commune, chaque polypeptide de la population comprenant la séquence d'acides aminés EXXXAXXEIX XLPNLTXXQX XAFIXKLXDD PSQSSELLSE AKKLNDSQ ou AKYAKEXXXAXX EIXXLPNLTX XQXXAFIXKL XDDPSQSSEL LSEAKKLNDS Q, dans laquelle chaque X correspond individuellement à un reste d'acide aminé qui varie dans la population. L'invention concerne également des populations de polynucléotides, dans lesquelles chaque élément code pour un élément de la population de polypeptides, chaque élément de la population de polypeptides étant spatialement ou physiquement associé au polynucléotide codant pour ledit membre par des moyens de couplage génotype-phénotype. L'invention concerne, de plus, des méthodes de sélection d'un polypeptide désiré présentant une affinité pour une cible prédéterminée d'une population de polypeptides, d'isolation d'un polynucléotide codant pour un polypeptide désiré présentant une affinité pour une cible prédéterminée, d'identification d'un polypeptide désiré présentant une affinité pour une cible prédéterminée, de sélection et d'identification d'un polypeptide désiré présentant une affinité pour une cible prédéterminée, et de production d'un polypeptide désiré présentant une affinité pour une cible prédéterminée.

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