Predictive marker for topoisomerase i inhibitors

G - Physics – 01 – N

Patent

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G01N 33/574 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01)

Patent

CA 2720184

The present invention generally relates to the fields of cancer therapy and cancer prevention. More particularly, the present invention generally relates to a diagnostic marker for predicting the efficacy of topoisomerase I (topo I) inhibitors in the treatment of cancers. More specifically, the present invention relates to methods, machines, computer systems, computable readable media and kits which can be used to identify and determine the effectiveness of topoisomerase I (topo I) inhibitors in the treatment of cancers, and in some embodiments, the level of sensitivity or resistance of a tumor cell to a topoisomerase I inhibitor, such as camptothecin (CPT), or CTP analogues such as topotecan and irinotecan and derivatives thereof. More specifically, the present invention related to methods, machines, computer systems, computable readable media and kits which can be used to determine the presence of phosphorylation of topoisomerase I polypeptide, in some embodiments phosphorylation at residue serine 10 (S10) of a topoisomerase I polypeptide, wherein the presence of phosphorylation, in particular the phosphorylation at serine 10 of a topol polypeptide indicates a cancer is likely to be unresponsive to a topo I inhibitor, whereas the absence of phosphorylation, in particular, the absence of phosphorylation at residue serine 10 (S10) identifies a cancer is likely to be responsive to a topo I inhibitor. Other aspect of the present invention relate to phospho-serine10 topoisomererase I antibodies and other protein binding moieties, and uses thereof.

La présente invention se rapporte, d'une façon générale, aux domaines de la thérapie du cancer et de la prévention du cancer. Plus particulièrement, la présente invention se rapporte, d'une façon générale, à un marqueur de diagnostic permettant de prédire l'efficacité des inhibiteurs de la topoisomérase I (topo I) dans le traitement des cancers. De façon plus précise, la présente invention se rapporte à des procédés, à des machines, à des systèmes informatiques, à des supports lisibles par ordinateur et à des trousses qui peuvent être utilisés pour identifier et déterminer l'efficacité des inhibiteurs de la topoisomérase I (topo I) dans le traitement des cancers et, dans certains modes de réalisation, le niveau de sensibilité ou de résistance d'une cellule tumorale à un inhibiteur de la topoisomérase I tel que la camptothécine (CPT), ou à des analogues de CPT tels que la topotécane et l'irinotécane et leurs dérivés. De façon plus précise, la présente invention se rapporte à des procédés, à des machines, à des systèmes informatiques, à des supports lisibles par ordinateur et à des trousses qui peuvent être utilisés pour déterminer la présence de la phosphorylation du peptide de topoisomérase I, dans certains modes de réalisation la phosphorylation au niveau d'une sérine au résidu 10 (S10) d'un polypeptide de topoisomérase I. La phosphorylation, en particulier  au niveau d'une sérine 10 d'un polypeptide de topo I, indique un cancer qui nest probablement sensible à un inhibiteur de la topo I, tandis que l'absence de phosphorylation, en particulier  au niveau de la sérine au résidu 10 (S10), identifie un cancer qui est probablement sensible à un inhibiteur de la topo I. Un autre aspect de la présente invention se rapporte aux anticorps anti-topoisomérase I contenant une phosphosérine 10 et à d'autres fragments de liaison de protéines et à leurs utilisations.

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