Protein interaction system for multisubunit complexes

G - Physics – 01 – N

Patent

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G01N 33/68 (2006.01) G01N 33/543 (2006.01) G01N 33/566 (2006.01)

Patent

CA 2483150

A protein interaction method and composition are described. The method and composition are useful for a number of purposes including: reconstituting multisubunit protein complexes, identifying known binding subunits, detrmining the kinetics and order of self assembly of a multsubunit protein complex, and drug screening. The method involves contacting a conjugate with a solid surface having an immobilized first coil-forming peptide characterized by a selected charge and an ability to interact with a second, oppositely carged coil-forming peptide to form a stable .alpha.-helical coiled-coil heterodimer, where the conjugate comprises (a) the second, oppositely charged coil-forming peptide, and (b) a first subunit polypeptide which is one of a plurality of subunit polypeptides in a multisubunit complex. By said contacting the conjugate is bound to the solid surface. Other subunit of the complex are added under conditions effective to promote self-assembly of the subunit complex or the solid surface.

L'invention concerne un procédé et une composition d'interaction de protéines. Ce procédé et cette composition sont utiles dans de nombreuses applications telles que la reconstruction de complexes protéiniques à multiples sous-unités, l'identification des sous-unités de liaison, la détermination de la cinétique et de l'ordre d'autoassemblage d'un complexe protéinique à multiples sous-unités et le dépistage de drogues. Ce procédé consiste notamment à mettre en contact un conjugué avec une surface solide présentant un premier peptide immobilisé formant une hélice et caractérisé en ce qu'il comprend une charge sélectionnée et en ce qu'il peut agir avec un second peptide formant une hélice et présentant une charge opposée. Ce procédé permet de former un hétérodimère bispiralé à hélice alpha, où le conjugué comprend (a) le second peptide formant une hélice à charge opposée, et (b) un premier polypeptide à sous-unité qui fait partie d'une pluralité de polypeptides à sous-unités dans un complexe à multiples sous-unités. Ce procédé de contact permet de lier le conjugué à la surface solide. D'autres sous-unités du complexe sont ajoutées dans des conditions efficaces pour favoriser l'autoassemblage du complexe à sous-unités sur la surface solide.

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