Protein phosphorylation in egfr-signaling pathways

Details Protein phosphorylation in egfr-signaling pathways Protein phosphorylation in egfr-signaling pathways

C - Chemistry, Metallurgy

07

K

C07K 16/28 (2006.01) C07K 16/00 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01) C12Q 1/48 (2006.01)

Patent

CA 2601700

The invention discloses 168 novel phosphorylation sites identified in signal transduction proteins and pathways downstream of, and including, EGFR kinase, and provides phosphorylation-site specific antibodies and heavy-isotope labeled peptides (AQUA peptides) for the selective detection and quantification of these phosphorylated sites/proteins, as well as methods of using the reagents for such purpose. Among the phosphorylation sites identified are sites occurring in the following protein types: Actin Binding proteins, Adaptor/Scaffold proteins, Calcium-Binding Proteins, Cell Cycle Regulation proteins, Cytoskeletal proteins, DNA Binding and Replication Proteins, GTPase Activating proteins, Guanine Nucleotide Exchange Factor proteins, Lipid Kinases, Receptor Tyrosine Kinases, Receptor Tyrosine Kinase ligands, Protein Kinases, Receptor and Protein Phosphatases, Transcription Factor proteins, Tumor Suppressor proteins, and Vesicle proteins.

La présente invention décrit 168 nouveaux sites de phosphorylation identifiés parmi les protéines de transduction de signal ainsi que dans les voies en aval de la EGFR kinase, incluant la EGFR kinase elle-même. La présente invention concerne également des anticorps spécifiques des sites de phosphorylation et des peptides marqués à l'aide d'isotopes lourds (peptides AQUA) permettant la détection et la quantification sélectives de ces sites et/ou protéines phosphorylés, ainsi que des méthodes d'emploi de réactifs pour aboutir à ce résultat. Parmi les sites de phosphorylation identifiés se trouvent des sites contenus dans les types de protéines suivants : protéines Liant l'Actine, protéines Adaptatrices/Pièges, Protéines Liant le Calcium, protéines de Régulation du Cycle Cellulaire, protéines du Cytosquelette, protéines de Liaison et de Réplication de l'ADN, protéines d~Activation de la GTPase, protéines de type Facteur d'Échange Nucléotidique de la Guanine, Lipide Kinases, Récepteurs Tyrosine Kinases, ligands de Récepteurs Tyrosine Kinases, Protéine Kinases, Phosphatases de Protéines et de Récepteurs, protéines de type Facteur de Transcription, protéines de type Élimination de Tumeurs, et protéines de Vésicule.

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