Protein phosphorylation in t-cell receptor signaling pathways

G - Physics – 01 – N

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G01N 33/68 (2006.01) C07K 7/00 (2006.01) C07K 16/00 (2006.01) C12Q 1/48 (2006.01)

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CA 2556022

The invention discloses 95 novel phosphorylation sites identified in signal transduction proteins and pathways downstream of the T-cell receptor, and provides phosphorylation-site specific antibodies and heavy-isotope labeled peptides (AQUA peptides) for the selective detection and quantification of these phosphorylated sites/proteins, as well as methods of using the reagents for such purpose. Among the phosphorylation sites identified are sites occurring in the following protein types: Actin Binding proteins, Adaptor/Scaffold proteins, Adhesion proteins, Calcium-binding proteins, Cell Cycle Regulation or Channel proteins, Chaperones, Cofactor proteins, Cytoskeletal proteins, DNA Binding proteins, G protein or GTPase Activating proteins, Ligases, Lipid Kinases and Binding proteins, Oxidoreductases, Protein Kinases, Protein Phosphatases, Receptor proteins, RNA Binding proteins, Transcription Factor/Initiation Complex proteins, Transcription Coactivator/Corepressor proteins, Translation Initiation Complex proteins, Ubitquitin Conjugating System proteins, and Vesicle proteins.

La présente invention se rapporte à 95 nouveaux sites de phosphorylation identifiés dans les protéines de transduction de signaux et les voies en aval du récepteur de lymphocytes T, et fournissant des anticorps spécifiques des sites de phosphorylation et des peptides marqués par isotopes lourds (peptides AQUA) poutr la détection sélective et la quantification de ces sites/protéines phosphorylé(e)s, ainsi qu'à des procédés de mise en oeuvre de réactifs à cet effet. Parmi les sites de phosphorylation identifiés se trouvent des sites présents dans les types de protéines suivants : protéines à liaison d'actine, protéines d'adaptation/d'ossature, protéines d'ahérence, protéines à liaison de calcium, protéines de canal ou de régulation du cycle cellulaire, chaperonines, protéines de type cofacteur, protéines cytosquelettiques, protéines à liaison d'ADN, protéines d'activation de protéine G ou de GTPase, ligases, lipide-kinases et protéines de liaison, oxydoréductases, protéine-kinases, protéine-phosphatases, protéines réceptrices, protéines à liaison d'ARN, protéines de type facteur de transcription/complexe d'initiation, protéines de type coactivateur de transcription/corépresseur, protéines de type complexe d'initiation de translation, protéines de type système de conjugaison d'ubiquitine, et protéines vésiculaires.

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