Qualitative differential screening for the detection of rna...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01)

Patent

CA 2504142

The invention concerns a method for identifying and/or cloning nucleic acid regions representing qualitative differences associated with alternative splicing events and/or with insertions, deletions located in RNA transcribed genome regions, between two physiological situations, comprising either hybridization of RNA derived from the test situation with cDNA's derived from the reference situation and/or reciprocally, or double-strand hybridization of cDNA derived from the test situation with cDNA's derived from the reference situation; and identifying and/or cloning nucleic acids representing qualitative differences. The invention also concerns compositions or banks of nucleic acids representing qualitative differences between two physiological situations, obtainable by the above method, and their use as probe, for identifying genes or molecules of interest, or still for example in methods of pharmacogenomics, and profiling of molecules relative to their therapeutic and/or toxic effects. The invention further concerns the use of dysregulation of splicing RNA as markers for predicting molecule toxicity and/or efficacy, and as markers in pharmacogenomics.

L'invention porte sur une méthode: d'identification et/ou de clonage de régions d'acides nucléiques représentant des différences qualitatives associées à des événements épisseurs alternatifs et/ou à des insertions et délétions situées dans les régions du génome transcrites à l'ARN entre deux situations physiologiques comprenant: soit une hybridation de l'ARN dérivant de la situation test où l'ADNc dérive de la situation de référence et/ou réciproquement, soit une hybridation de l'ADNc double brin dérivant de la situation test où l'ADNc dérive de la situation de référence; et/ou d'identification et/ou de clonage d'acides nucléiques présentant des différences qualitatives. L'invention porte également sur des compositions ou banques d'acides nucléiques représentant des différences qualitatives entre deux situations physiologiques, et obtenues à l'aide de la méthode ci-dessus, et sur leur utilisation: comme sondes pour identifier des gènes ou molécules d'intérêt, ou encore par exemple dans des méthodes de pharmacogénomique, et pour profiler des molécules du point de vue de leurs effets thérapeutiques et/ou toxiques. L'invention porte en outre sur l'utilisation de la dérégulation des ARN épisseurs comme marqueurs prédisant la toxicité et/ou l'efficacité de molécules et comme marqueurs de pharmacogénomique.

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