Quantitation of biological molecules

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G - Physics

01

N

G01N 33/68 (2006.01) G01N 30/72 (2006.01) H01J 49/00 (2006.01)

Patent

CA 2484078

Methods and apparatus, including computer program products, for quantifying peptides in a peptide mixture. A peptide mixture containing a plurality of peptides is received. One or more peptides are separated from the peptide mixture over a period of time. One or more of the peptides separated at a particular time are subjected to mass-to-charge analysis and an abundance of one or more of the mass analyzed peptides is calculated. A relative quantity for the one or more mass analyzed peptides is calculated by comparing the calculated abundance of the peptides with an abundance of one or more peptides in a reference sample that is external to the first peptide mixture. The techniques can be applied to arbitrary peptides, without requiring the use of differential mass labeling, and can be applied to other biological molecules, such as nucleic acids and small molecules.

L'invention concerne des procédés et un dispositif, y compris, des produits de programme informatique, permettant de quantifier des peptides dans un mélange peptidique. Un mode de réalisation décrit dans cette invention consiste à recevoir un mélange peptidique contenant plusieurs peptides. Un ou plusieurs des peptides séparés du mélange peptidique à un moment spécifique sont soumis à une analyse masse/charge et une quantité d'un ou de plusieurs peptides analysés en masse est calculée. Une quantité relative d'un ou de plusieurs peptides analysés en masse est calculée par comparaison de la quantité calculée de peptides avec une quantité d'un ou de plusieurs peptides dans un échantillon de référence qui est externe au premier mélange peptidique. Ces techniques peuvent être appliquées à des peptides arbitraires, sans utilisation d'un marquage différentiel de masse, et elles peuvent être appliquées à d'autres molécules biologiques, telles que les acides nucléiques et les petites molécules.

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