Quantitative methods, systems and apparatuses for gene...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2331510

The present invention provides methods for quantifying the relatedness of a first and second gene expression profile and for ordering the relatedness of a plurality of gene expression profiles to a single preselected gene expression profile. The methods are demonstrated to be useful for quantifying the relatedness of environmental conditions upon a cell, such as the relatedness in effects of pharmaceutical agents upon a cell. The methods are also useful in quantifying the relatedness of a preselected environmental condition to a defined genetic mutation of a cell and for quantifying the relatedness of a plurality of genetic mutations. Also presented are systems and apparatuses for performing the subject methods. Further provided are quantitative methods, systems, and apparatuses for selecting informative subsets of genes for gene expression analysis.

L'invention concerne des procédés permettant de quantifier la parenté d'un premier et d'un second profils d'expression génique, et de classer la parenté d'une pluralité de profils d'expression génique, en un seul profil d'expression génique présélectionné. Ces procédés se sont révélés utiles pour quantifier la parenté des conditions environnementales sur une cellule, telle que la parenté dans des effets d'agents pharmaceutiques sur une cellule. Ces procédés sont également utiles dans la quantification de la parenté d'une condition environnementale présélectionnée en une mutation génétique définie d'une cellule, et dans la quantification de la parenté d'une pluralité de mutations génétiques. L'invention concerne également des systèmes et des appareils permettant d'exécuter les procédés de l'invention. L'invention concerne, en outre, des appareils, des systèmes et des procédés permettant de sélectionner des sous-ensembles informatifs de gènes pour une analyse d'expression génique.

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