Randomly generated glycopeptide combinatorial libraries

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – K

Patent

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Details

C07K 1/04 (2006.01) C07K 14/47 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01)

Patent

CA 2302472

Randomly generated glycopeptide combinatorial libraries are generated by randomly glycosylating a peptide having at least one glycosylation site with at least one glycosyl donor, optionally blocking unreacted glycosylation sites on the glycopeptides and optionally selectively removing one or more protecting groups on the carbohydrate groups introduced at the first level; whereby a first level library of glycopeptides is created; and then optionally randomly glycosylating said first level library of glycopeptides, or a combination of first level libraries of glycopeptides, with at least one glycosyl donor, and optionally selectively removing one or more designated protecting groups on the carbohydrate groups introduced at the second level; whereby a second level library of glycopeptides is created. Further iterations of the process result in higher level libraries of increased diversity. The glycopeptide libraries including, e.g., carcinoma-associated mucins such as MUC1, are screened for drug-like, competitive inhibitory, immunostimulatory, antibody-like, and other biological activities.

Selon cette invention, on génère de manière aléatoire des banques combinatoires de glycopeptides par glycosylation aléatoire d'un peptide possédant au moins un site de glycosylation et au moins un donneur glycosyle, par blocage éventuel sur les glycopeptides des sites de glycosylation n'ayant pas réagi et par élimination sélective, éventuelle, d'un ou plusieurs groupes protecteurs sur les groupes d'hydrates de carbone introduit au premier niveau. On obtient ainsi une banque de glycopeptides de premier niveau. On procède ensuite à la glycosylation aléatoire, éventuelle, de la banque de glycopeptides de premier niveau, ou d'une combinaison de banques de glycopeptides, avec au moins un donneur glycosyle, puis à l'élimination sélective, éventuelle, d'un ou plusieurs groupes protecteurs désignés sur les groupes d'hydrates de carbone introduits au second niveau. On obtient alors une banque de glycopeptides de second niveau. Le procédé se répète de façon à obtenir des banques de niveau supérieur d'une plus grande diversité. On effectue une recherche des banques de glycopeptides renfermant, par exemple, des mucines associées aux carcinomes telles que MUC1 pour déterminer les activités de type médicamenteuses, d'inhibition compétitive, d'immunostimulation, de type anticorps et autres activités biologiques.

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