Receptor selectivity mapping

G - Physics – 06 – F

Patent

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Details

G06F 19/26 (2011.01) G06F 19/28 (2011.01) G06F 17/30 (2006.01)

Patent

CA 2371093

A computer system comprising a first database containing records corresponding to a plurality of chemical compounds and records corresponding to biological information related to effects of the plurality of chemical compounds on biological systems and a second database containing records corresponding to a plurality of molecular targets. The computer system further comprises a third database containing records corresponding to tests of ineraction between compounds in the first database and molecular targets in the second database, the tests including information on the effect that a compound from the plurality of compounds has on the interaction of a compound known to interact with a molecular target from the plurality of molecular targets and said molecular target. Means for setting an interaction test threshold corresponding to said effect and means for selecting the compound when its use results in a test meeting the interaction test threshold are also included in the computer system. A user interface is provided to allow a user to view the selected compound and to selectively view information from the first database, the second database, the third database as it relates to a compound record in the first database or as it relates to a molecular target in the second database.

L'invention concerne un système informatique comportant une première base de données contenant des enregistrements correspondant à une pluralité de composés chimiques et des enregistrements correspondant à des informations biologiques associées aux effets de la pluralité desdits composés chimiques sur des systèmes biologiques, ainsi qu'à une deuxième base de données contenant des enregistrements correspondant à une pluralité de cibles moléculaires. Le système informatique comporte également une troisième base de données contenant des enregistrements correspondant à des essais d'interaction entre des composés de la première base de données et des cibles moléculaires de la deuxième base de données, lesdits essais incluant des informations relatives à l'effet qu'a un composé choisi parmi la pluralité de composés sur l'interaction d'un composé connu comme agissant sur une cible moléculaire appartenant à la pluralité de cibles moléculaires et de ladite cible moléculaire. Ledit système informatique comporte en outre des moyens de définition d'un seuil d'essai d'interaction correspondant audit effet et des moyens de sélection du composé lorsque son utilisation se traduit par un essai conforme au seuil d'essai d'interaction. Une interface utilisateur permet à un utilisateur de visualiser le composé sélectionné et de visualiser des informations de la première base de données, de la deuxième base de données et de la troisième base de données du fait que ce composé est associé à un enregistrement de composé dans la première base de données et à une cible moléculaire dans la deuxième base de données.

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