Scoring system for the prediction of cancer recurrence

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/574 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)

Patent

CA 2455649

The present invention relates to a scoring system for the prediction of cancer recurrence. More particularly, the present invention concerns with the selection of genes and/or proteins, and generation of formulae with the selected genes and/or proteins for the prediction of cancer recurrence by measuring the expression of genes and/or proteins of human tumor tissues, and comparing their patterns with those of the gene and/or protein expression of human primary tumors from patients who have cancer recurrence and those who do not have cancer recurrence. The present invention also relates to a kit for performing the method of the present invention comprising DNA chip, oligonucleotide chip, protein chip, peptides, antibodies, probes and primers that are necessary for effecting DNA microarrays, oligonucleotide microarrays, protein arrays, northern blotting, in situ hybridization, RNase protection assays, western blotting, ELISA assays, reverse transcription polymerase-chain reaction (hereinafter referred to as RT-PCR) to examine the expression of at least 2 or more of genes and/or proteins, preferably 4 or more of genes and/or proteins, more preferably 6 or more of genes and/or proteins, and most preferably 12 or more of genes and/or proteins, that are indicative of cancer recurrence.

L'invention concerne un système d'évaluation pour prédire une récurrence de cancer. Plus particulièrement, l'invention concerne un procédé consistant à sélectionner des gènes et/ou des protéines, et à produire des formules utilisant les gènes et/ou protéines sélectionné(e)s afin de prédire une récurrence de cancer ; ce procédé comporte les étapes consistant à mesurer l'expression de gènes et/ou de protéines de tissus tumoraux humains, et à comparer leurs motifs avec ceux de l'expression de gènes et/ou de protéines de tumeurs primaires humaines provenant de patients qui présentent une récurrence de cancer ou qui n'en présentent pas. L'invention concerne aussi une trousse permettant de mettre en oeuvre le procédé, y compris une puce à ADN, une puce à oligonucléotides, une puce à protéines, des peptides, des anticorps, des sondes et des amorces nécessaires à la mise en oeuvre d'arrangements de biopuces, d'oligonucléotides et de protéines, de techniques de transfert d'ADN, d'hybridation in situ, de techniques de protection de RNase, de transferts de type western, de dosages ELISA, de transcription inverse-amplification en chaîne par polymérase (appelée ci-après RT-PCR) en vue d'examiner l'expression d'au moins deux ou davantage de gènes et/ou de protéines, de préférence quatre ou davantage, mieux encore six ou davantage et idéalement douze ou davantage de gènes et/ou de protéines indiquant une récurrence de cancer.

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