G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 33/48 (2006.01) G01N 1/20 (2006.01) G01N 33/52 (2006.01)
Patent
CA 2673946
Methods for proteomic analysis are provided. For example, in one aspect a method for identifying and sequencing a peptide may include fractionating a biological sample containing a peptide of interest to at least partially isolate the peptide, obtaining mass spectra of the peptide, and accelerating the peptide into a collision chamber at a plurality of discrete collision energies for a discrete period of time to form a plurality of peptide fragments for each of the plurality of discrete collision energies. The method may further include obtaining a plurality of fragmentation mass spectra from the plurality of peptide fragments for each of the plurality of discrete collision energies, summing the plurality of fragmentation mass spectra from each of the plurality of discrete collision energies to form a plurality of discrete collision energy mass spectra, one discrete collision energy mass spectra from each discrete collision energy, summing the plurality of discrete collision energy mass spectra to form a final mass spectrum for the peptide fragments, and identifying a sequence of amino acids corresponding to the peptide from the final mass spectrum.
L'invention concerne des procédés pour une analyse de protéomique. Par exemple, sous un aspect, un procédé pour identifier et séquencer un peptide peut comprendre le fractionnement d'un échantillon biologique contenant un peptide d'intérêt pour isoler au moins partiellement le peptide, l'obtention de spectres de masse du peptide et l'accélération du peptide dans une chambre de collision à une pluralité d'énergies de collision discrètes pendant une période de temps discrète pour former une pluralité de fragments peptidiques pour chacune des différentes énergies de collision discrètes. Le procédé peut en outre comprendre l'obtention d'une pluralité de spectres de masse de fragmentation à partir des différents fragments peptidiques pour chacune des différentes énergies de collision discrètes, la sommation des différents spectres de masse de fragmentation à partir de chacune des différentes énergies de collision discrètes pour former une pluralité de spectres de masse à énergie de collision discrète, un spectre de masse à énergie de collision discrète à partir de chaque énergie de collision discrète, la sommation des différents spectres de masse à énergie de collision discrète pour former un spectre de masse final pour les fragments peptidiques, et l'identification d'une séquence d'acides aminés correspondant au peptide à partir du spectre de masse final.
Esplin Michael Sean
Graves Steven William
Thulin Craig Dan
Brigham Young University
Gowling Lafleur Henderson Llp
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1724109