C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
N
C12N 15/11 (2006.01) C07H 21/02 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2409752
Nucleic acid (e.g., DNA) hybridization probes are described which comprise a labeled, single copy nucleic acid which hybridizes to a deduced single copy sequence interval in target nucleic acid of known sequence. The probes, which are essentially free of repetitive sequences, can be used in hybridization analyses without adding repetitive sequence-blocking nucleic acids. This allows rapid and accurate detection of chromosomal abnormalities. The probes are preferably designed by first determining the sequence of at least one single copy interval in a target nucleic acid sequence, and developing corresponding hybridization probes which hybridize to at least a part of the deduced single copy sequence. In practice, the sequences of the target and of known genomic repetitive sequence representatives are compared in order to deduce locations of the single copy sequence intervals. The single copy probes can be developed by any variety of methods, such as PCR amplification, restriction or exonuclease digestion of purified genomic fragments, or direct synthesis of DNA sequences. This is followed by labeling of the probes and hybridization to a target sequence.
La présente invention concerne des sondes d'hybridation d'acides nucléiques (par exemple, l'ADN) comportant un acide nucléique à copie unique marqué qui s'hybride à un intervalle de séquence à copie unique dans un acide nucléique cible de séquence connue. Les sondes, qui sont essentiellement dépourvues de séquences répétitives, peuvent être utilisées dans des dosage d'hybridation sans ajout d'acides nucléiques répétitifs de blocage de séquence. Cela permet de détecter de manière rapide et précise les anomalies chromosomiques. De préférence, les sondes sont réalisées par la détermination de la séquence d'au moins un intervalle à copie unique dans une séquence d'acides nucléiques cible, et par le développement de sondes d'hybridation correspondantes qui s'hybrident à au moins une partie de la séquence à copie unique déduite. Dans la pratique, on compare les séquences du cible et les éléments représentatifs de la séquence répétitive génomique connue afin d'en déduire les emplacements des intervalles de la séquence à copie unique. Les sondes à copie unique peuvent être développées par divers procédés, tels l'amplification PCR, la restriction ou la digestion d'exonucléases de fragments de génome purifiés, ou la synthèse directe de séquences d'ADN. Ensuite on effectue un marquage des sondes et l'hybridation à une séquence cible.
Cazcarro Patricia M.
Knoll Joan H. M.
Rogan Peter K.
Children's Mercy Hospital
Gowling Lafleur Henderson Llp
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-2036445