Single-molecule platform for drug discovery: methods and...

G - Physics – 01 – N

Patent

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Details

G01N 33/567 (2006.01) C12M 1/34 (2006.01) C12N 9/22 (2006.01)

Patent

CA 2646309

The present application discloses methods and apparatuses for single molecule drug screening, discovery and validation. These methods and apparatuses allow a user to detect rapidly, using observation of single molecules, whether and how a drug candidate interferes with a target enzyme involved in a particular disease pathway. The methods and apparatuses described herein utilize single molecule manipulation and detection technologies (e.g., optical or magnetic tweezers) to directly detect whether the characteristic dynamics, or "mechanical signature," of the target enzyme-substrate interaction are substantially altered or modulated by a drug candidate. Furthermore, the methods and apparatuses are useful for analyzing the modulation of the mechanical signature in order to identify potential interference mechanisms of a drug candidate. In one aspect of the invention, the methods and apparatuses disclosed herein relate to monitoring the real-time dynamic mechanical signatures of individual polymerase molecules (e.g. DNA polymerases, RNA polymerases, and reverse transcriptases) along a polynucleotide substrate in the presence of drug candidates that either inhibit or otherwise modulate the polymerization process. Identification and analysis of such drug candidates is critical for anti-viral, anti-cancer, and antibiotic drug development.

La présente invention concerne des procédés et des appareils pour le criblage, la découverte et la validation de médicaments à molécules simples. Ces procédés et appareils permettent à un utilisateur de découvrir rapidement, au moyen d'observation de molécules simples, si et comment des molécules simples candidates interfèrent avec une enzyme cible impliquée dans une voie de maladie particulière. Les procédés et appareils selon l'invention utilisent une manipulation de molécules simples et des technologies de détection (par exemple, des pinces optiques ou magnétiques) pour détecter directement si la dynamique des caractéristiques, ou "signature mécanique", de l'interaction enzyme cible-substrat est sensiblement altérée ou modulée par un médicament candidat. En outre, les procédés et appareils sont utiles pour analyser la modulation de la signature mécanique afin d'identifier des mécanismes d'interférence potentiels d'un médicament candidat. Selon un aspect de l'invention, les procédés et appareils selon la présente invention concernent le suivi en temps réel des signatures mécaniques dynamiques de molécules de polymérases individuelles (par exemple, les ADN polymérases, les ARN polymérases,et les transcriptases inverses) le long d'un substrat polypeptidique en présence de médicaments candidats qui sont inhibiteurs ou autrement modulateurs du procédé de polymérisation. L'identification et l'analyse de tels médicaments candidats sont importantes pour le développement de médicaments antiviraux, anticancéreux et antibiotiques.

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