Substrate linked directed evolution (slide)

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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C12N 15/10 (2006.01) C07K 14/705 (2006.01) C12N 9/00 (2006.01) C12N 9/22 (2006.01) C12N 15/52 (2006.01) C12N 15/62 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2430378

The invention relates to methods for the evolution of molecules with improved biological properties. In particular, the invention relates to methods using proteins that modify a DNA substrate to establish a link between the action of these proteins and the selection of molecules with improved biological properties. A unifying feature of all these mechanisms is that the coding region being evolved is in the same genetic element or on the same DNA molecule as a target site for a DNA-modifying protein. Accordingly, the activity (or inactivity) of the DNA-modifying protein can be tested by evaluating the sequence of its nucleic acid substrate. In this manner, a number of different types of compounds may be selected, including improved DNA- modifying proteins, improved substrates for DNA-modifying proteins, improved ligand-receptor interactions, improved co-factor and regulatory protein activities, improved DNA-binding proteins, and so on.

L'invention concerne des procédés conçus pour l'évolution de molécules présentant des propriétés biologiques améliorées. En particulier, l'invention concerne des procédés qui utilisent des protéines qui modifient un substrat d'ADN pour établir un lien entre l'action de ces protéines et la sélection de molécules aux propriétés biologiques améliorées. Une caractéristique unificatrice de tous ces mécanismes est que la région de codage en évolution se trouve dans le même élément génétique ou sur la même molécule D'ADN comme site cible pour une protéine modifiant l'ADN. En conséquence, pour tester l'activité (ou l'inactivité) de la protéine modifiant l'ADN, on évalue la séquence de son substrat d'acide nucléique. Ainsi, on peut choisir un certain nombre de types différents de composés, y compris des protéines modifiant l'ADN améliorées, des substrats améliorés pour protéines modifiant l'ADN, des interactions améliorées ligand-récepteur, des activités améliorées de protéines régulatrices et cofactrices, des protéines de fixation améliorées de l'ADN, et ainsi de suite.

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