Surface simulation synthetic peptides useful in the...

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – K

Patent

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C07K 14/16 (2006.01) A61K 38/02 (2006.01) A61K 38/16 (2006.01) A61K 39/21 (2006.01) A61P 31/18 (2006.01) C07K 7/08 (2006.01) C30B 29/58 (2006.01) G01N 23/20 (2006.01) G01N 31/00 (2006.01) G01N 33/48 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)

Patent

CA 2468849

Synthetic peptides and methods for configuring the amino acid sequences thereof are disclosed which are especially useful in the preparation of vaccines intended for the prophylaxis and treatment of viral pathogens exhibiting high mutation rates such as HIV-1. The high mutation rates of such viral pathogens result in extreme variance in the linear sequence of viral protein residues, such as the variable linear sequences of gp 120 of HIV-1. To be effective and provide broad-spectrum and/or cross-clad coverage against hypervariable viruses such as HIV-1, vaccines must target common denominators of all infective strains of such a virus. These functional common denominators lie in the 3-dimensional configuration of proteins essential for host cell binding and infectivity. The disclosed peptides and methods for configuring same are derived from the 3 dimensional relationships of conserved residues of viral proteins defining conformational epitopes necessary and required for viral pathogenicity.

L'invention se rapporte à des peptides synthétiques et à des procédés de configuration de séquences d'acide aminé de ces derniers, notamment utiles dans la préparation de vaccins servant à la prophylaxie et au traitement de pathogènes viraux présentant des taux de mutation élevés tels que HIV-1. Les taux de mutation élevés de ces pathogènes viraux entraînent une variance extrême dans la séquence linéaire des résidus de protéine virale, telles que les séquences linéaires variables de gp 120 of HIV-1. Afin d'être efficaces et de fournir une couverture à large spectre et/ou à gaine transversale contre des virus hypervariables tels que HIV-1, les vaccins doivent cibler des dénominateurs communs de toutes les souches d'un tel virus. Ces dénominateurs communs fonctionnels sont présents dans les configuration tridimensionnelle des protéines essentielles à la liaison et à l'infectiosité de cellules hôtes. Les peptides et les procédés de l'invention configurant les mêmes séquences sont issus d'une relation tridimensionnelle de résidus conservés de protéines virales définissants des épitopes conformationnels nécessaires et indispensables à la pathogénie virale.

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