Surrogate genetics target characterization method

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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Details

C12N 15/10 (2006.01) C12Q 1/02 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2277414

A two-step, scalable method is described for identifying the cellular function(s) of one or more genes of unknown function, and for identifying modulators or the gene(s). The method uses the reversal or alteration of a phenotype created by the expression of the heterologous gene, e.g., a human gene, to identify modulators of that gene's activity. That modulator is then used in an in vitro or in vivo disease model system to identify compounds which affect disease progression. The subset of compounds which influence disease in a therapeutic manner are drug leads. However, all compounds which influence disease progression are tools to at least partially characterize gene function. The inhibitor identification step or the method is preferably carried out using a plurality of microbial strains or cell lines expressing different heterologous DNA sequences in a single solution. The method is particularly useful for genes which have not been validated as good inhibitor targets.

L'invention concerne un procédé en deux étapes, modifiable, d'identification de la (des) fonction(s) cellulaire(s) d'un ou de plusieurs gènes à fonction inconnue, et d'identification de modulateurs de ce (ces) gène(s). Dans ce procédé on utilise l'inversion ou l'altération d'un phénotype créé par l'expression d'un gène hétérologue, par exemple un gène humain, afin d'identifier des modulateurs de cette activité du (des) gène(s). On utilise ensuite ce modulateur dans un système de modèle de maladie in vitro ou in vivo, afin d'identifier des composés affectant la progression d'une maladie. La sous-population de composés qui exercent une influence thérapeutique sur une maladie constitue des chefs de file d'une famille de médicaments. Cependant, tous les composés influençant la progression d'une maladie constituent des outils destinés à au moins caractériser partiellement une fonction génique. L'étape du procédé d'identification de l'inhibiteur s'effectue, de préférence, au moyen de plusieurs souches ou lignées cellulaires microbiennes exprimant différentes séquences d'ADN hétérologues, dans une seule solution. Ce procédé est notamment utile pour des gènes qui n'ont pas été validés comme de bonnes cibles d'inhibiteur.

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