Synthetic genomes

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – P

Patent

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Details

C12P 19/34 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12N 1/00 (2006.01) C12N 5/02 (2006.01) C12N 5/04 (2006.01) C12N 15/64 (2006.01)

Patent

CA 2643356

Methods are provided for constructing a synthetic genome, comprising generating and assembling nucleic acid cassettes comprising portions of the genome, wherein at least one of the nucleic acid cassettes is constructed from nucleic acid components that have been chemically synthesized, or from copies of the chemically synthesized nucleic acid components. In one embodiment, the entire synthetic genome is constructed from nucleic acid components that have been chemically synthesized, or from copies of the chemically synthesized nucleic acid components. Rational methods may be used to design the synthetic genome (e.g., to establish a minimal genome and/or to optimize the function of genes within a genome, such as by mutating or rearranging the order of the genes). Synthetic genomes of the invention may be introduced into vesicles (e.g., bacterial cells from which part or all of the resident genome has been removed, or synthetic vesicles) to generate synthetic cells. Synthetic genomes or synthetic cells may be used for a variety of purposes, including the generation of synthetic fuels, such as hydrogen or ethanol.

L'invention concerne des procédés de construction d'un génome synthétique, consistant à générer et à assembler des cassettes d'acides nucléiques comprenant des parties du génome, une des cassettes d'acides nucléiques au moins étant construite à partir de composants d'acides nucléiques ayant été synthétisés de manière chimique, ou à partir de copies des composants d'acides nucléiques synthétisés de manière chimique. Dans un mode de réalisation, le génome synthétique est construit à partir de composants d'acides nucléiques ayant été synthétisés de manière chimique, ou à partir de copies des composants d'acides nucléiques synthétisés de manière chimique. Des procédés rationnels peuvent être utilisés pour concevoir le génome synthétique (par exemple pour obtenir une génome minimal et/ou optimiser la fonction des gènes dans un génome, par exemple par mutation ou réorganisation des gènes). Les génomes synthétiques de l'invention peuvent être introduits dans des vésicules (par exemple des cellules bactériennes dans lesquelles tout le génome a été éliminé, ou une partie de celui-ci, ou des vésicules synthétiques) pour générer des cellules synthétiques. Les génomes synthétiques ou les cellules synthétiques peuvent être utilisés à diverses fins, y compris la génération de combustibles synthétiques tels que l'hydrogène ou l'éthanol.

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