System and method for integrated analysis of data for...

G - Physics – 06 – F

Patent

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G06F 19/00 (2011.01) G01N 33/53 (2006.01) G06F 17/30 (2006.01) C40B 30/02 (2006.01)

Patent

CA 2428431

A system and method for characterizing carbohydrate polymers according to maps obtained from experimental data. Preferably, the data is obtained from a plurality of different types of experimental assays for characterizing the carbohydrate polymer. More preferably, at least one such assay involves binding a saccharide-binding agent to the carbohydrate polymer. One or more features of the carbohydrate polymer are then preferably characterized. These features are preferably derived from maps of the data obtained from assays involving the sample carbohydrate polymer. These maps are more preferably analyzed at a plurality of levels, with each level providing more abstract biological information. Most preferably, new types of experimental data are introduced to the process of analysis at each level, in order to support more complex analyses of the data. Optionally and most preferably, maps are eliminated at each level as being inconsistent with the experimental data. New maps are most preferably added at a higher level only if they are derived from the new experimental data which has been introduced at that level, in order to prevent a combinatorial explosion at successive levels of data analysis.

L'invention concerne un système et un procédé de caractérisation de polymères carbohydrates conformément à des cartes obtenues à partir de données expérimentales. De préférence, les données sont obtenues à partir d'une pluralité de différents types d'analyses expérimentales aux fins de caractérisation du polymère carbohydrate. Encore de préférence, au moins une telle analyse consiste à lier un agent de liaison au saccharide au polymère carbohydrate. Une ou plusieurs caractéristiques du polymère carbohydrate sont ensuite, de préférence, caractérisées. Ces caractéristiques sont, de préférence, dérivées de cartes des données obtenues à partir d'analyse renfermant le polymère carbohydrate échantillon. Ces cartes sont, de préférence, analysées à une pluralité de niveaux, chaque niveau fournissant plus d'informations biologiques abstraites. De préférence, des nouveaux types de données expérimentales sont introduits dans le procédé d'analyse à chaque niveau, de manière à permettre des analyses plus complexes des données. Eventuellement et de préférence, des cartes sont éliminées à chaque niveau du fait qu'elles sont incompatibles avec les données expérimentales. De nouvelles cartes sont, de préférence, ajoutées à un niveau supérieur, seulement si elles sont dérivées des nouvelles données expérimentales ayant été introduites à ce niveau, de manière à empêcher une explosion combinatoire à des niveaux successifs d'une analyse de données.

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