G - Physics – 06 – F
Patent
G - Physics
06
F
G06F 19/00 (2006.01) G06F 17/11 (2006.01) G06F 17/30 (2006.01) G06N 3/00 (2006.01) C12M 1/00 (2006.01)
Patent
CA 2399272
Genetic, biochemical, biophysical and anatomical information is integrated at the subcellular, cellular, tissue and organ level. At least one database containing biological information is used to generate at least one data structure having at least one attribute associated therewith. An interface interactively views, edits or links together attributes of the data structures to create at least one hierarchical description of subcellular, cellular, tissue and organ function. The hierarchical description may optionally be an elementary, binary or pathway data structure, or, alternatively, an anatomical data structure capable of being modified to form a structural model. A computational engine mathematically generates at least one data structure from the hierarchical description. Genetic information is accessed, tabulated and combined with functional information on the biochemical and physiological role of gene products. Computational models of genetic, biochemical and biophysical processes within cells and higher order systems are automatically formulated, solved and analyzed based on combination of genetic and functional information adduced. A dynamic tool is thereby provided for achieving discernible objectives, such as increased understanding of biological processes, identification of new drug targets for therapeutic intervention and predictions involving the outcome of drug screening. These objectives are accomplished by the realization of highly complex nonlinear dynamic interactions that occur between each gene or gene product.
Les informations génétiques, biochimiques, biophysiques et anatomiques sont intégrées au niveau infracellulaire et cellulaire, au niveau du tissu et de l'organe. Au moins une base de données contenant des informations biologiques est utilisée pour générer au moins une structure de données à laquelle un attribut au moins se trouve associé. Une interface permet, de manière interactive, de visualiser, d'éditer ou de relier des attributs de structures de données pour établir au moins une description hiérarchique des fonctions infracellulaire, cellulaire, tissulaire et organique. La description hiérarchique peut être optionnellement une structure de données élémentaire, binaire ou de cheminement, ou bien encore, une structure de données anatomique pouvant être modifiée pour constituer un modèle structurel. Un calculateur génère mathématiquement au moins une structure de données à partir de la description hiérarchique. Les informations génétiques sont consultées, présentées sous forme de tableaux et combinées à des informations fonctionnelles relatives au rôle biochimique et physiologique de produits géniques. Des modèles de calcul de processus génétiques, biochimiques et biophysiques à l'intérieur de cellules et de systèmes d'ordre supérieur sont automatiquement établis, résolus et analysés sur la base de la combinaison des informations génétiques et des informations fonctionnelles ajoutées. On obtient ainsi un dispositif dynamique qui sert à réaliser des objectifs mis en évidence, tels qu'une meilleure compréhension des processus biologiques, l'identification de nouvelles cibles médicamenteuses pour l'intervention thérapeutique, et les prédictions quant aux résultats du criblage de médicaments. Ces objectifs sont réalisés par la création d'interactions dynamiques non linéaires hautement complexes qui interviennent entre chaque gène ou produit génique.
Jim Kam-Chuen
Lett Gregory Scott
Li Jian
Pestano Gary Anthony
Ramakrishna Ramprasad
Gowling Lafleur Henderson Llp
Physiome Sciences Inc.
LandOfFree
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