G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 33/50 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C40B 30/00 (2006.01) G01N 30/72 (2006.01) G01N 30/96 (2006.01) G06F 17/30 (2006.01)
Patent
CA 2370539
A data structure, tangibly embodied in a computer-readable medium, representing a polymer of chemical units is disclosed. The data structure includes an identifier including a plurality of fields for storing values corresponding to properties of the polymer. In one embodiment, the fields are capable of storing binary values. The polymer may, for example, be a polysaccharide and the chemical units may be saccharides. A computer-implemented method for determining whether properties of a query sequence of chemical units match properties of a polymer of chemical units. The query sequence is represented by a first data structure, tangibly embodied in a computer-readable medium, including an identifier including a plurality of bit fields for storing values corresponding to properties of the query sequence. The polymer is represented by a second data structure, tangibly embodied in a computer-readable medium, including an identifier including a plurality of bit fields for storing values corresponding to properties of the polymer. The invention also relates to methods of sequencing polymers such as nucleic acids, polypeptides and polysaccharides and methods for identifying a polysaccharide-protein interaction. The invention also involves a notational system referred to as Property Encoded Nomenclature.
L'invention porte sur une structure de données tangiblement fixée sur un support lisible par ordinateur représentant un polymère d'unités chimiques. Ladite structure comporte un identificateur à plusieurs domaines de stockage de valeurs correspondant aux différentes propriétés du polymère. Dans l'une des exécutions, lesdits domaines peuvent stocker des valeurs binaires; le polymère peut par exemple être un polysaccharide et les unités chimiques être des saccharides. L'invention porte également sur un procédé informatisé permettant de déterminer si les propriétés d'une séquence à analyser correspondent à celles d'un polymère d'unités chimiques. La séquence à analyser est représentée par une première structure de données tangiblement fixée sur un support lisible par ordinateur comportant un identificateur à plusieurs domaines de bits de stockage de valeurs correspondant aux propriétés de la séquence à analyser. Le polymère est représenté par une deuxième structure de données tangiblement fixée sur un support lisible par ordinateur comportant un identificateur à plusieurs domaines de bits de stockage de valeurs correspondant aux propriétés du polymère. L'invention porte en outre: sur des méthodes de séquençage de polymères tels que des acides nucléiques, des polypeptides et des polysaccharides; sur des méthodes d'identification d'une réaction polysaccharide/protéine; ainsi que sur un système de notation dit "nomenclature codée de propriétés".
Keiser Nishla
Raman Rahul
Sasisekharan Ram
Shriver Zachary
Venkataraman Ganesh
Massachusetts Institute Of Technology
Smart & Biggar
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1622964