G - Physics – 06 – G
Patent
G - Physics
06
G
G06G 7/48 (2006.01) G01N 33/48 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2432757
A method of associating a phenotype with one or more candidate chromosomal regions in a genome of an organism includes the step of deriving a phenotypic data structure that represents differences in phenotypes between different strains of the organism. Further, a genotypic data structure is established. The genotypic data structure corresponds to a locus selected from a plurality of loci in the genome of the organism. The genotypic data structure represnts variations of at least one componenet of the locus between different strains of the organism. The phenotypic data structure is compared to the genotypic data structure to form a correlation value. The process of establishing a genotypic data structure and comparing it to the phenotypic data structure is repeated for each locus in the plurality of loci, thereby identifying one or more genotypic data structures that form a high correlation value relative to all other compared genotypic data structures. The loci that correspond to the one or more genotypic data structures having a high correlation value represent the one or more candidate chromosomal regions.
La présente invention concerne une méthode permettant d'associer un phénotype à une ou plusieurs régions chromosomiques candidates dans un génome d'un organisme. Ladite méthode comprend l'étape consistant à dériver une structure de données phénotypiques qui représente des différences de phénotypes entre différentes souches de l'organisme. De plus, une structure de données génotypiques est établie. La structure de données génotypiques correspond à un locus sélectionné dans une pluralité de locus dans le génome de l'organisme. La structure de données génotypiques représente des variations d'au moins un constituant du locus entre différentes souches de l'organisme. La structure de données phénotypiques est comparée à la structure de données génotypiques de manière à obtenir une valeur de corrélation. Le procédé consistant à établir une structure de données génotypiques et à la comparer à la structure de données phénotypiques est répété pour chaque locus dans la pluralité des locus, ce qui permet d'identifier une ou plusieurs structures de données génotypiques qui permettent d'obtenir une valeur de corrélation élevée par rapport à toutes les autres structures de données génotypiques comparées. Les locus qui correspondent à une ou plusieurs structures de données génotypiques possédant une valeur de corrélation élevée représentent la ou les régions chromosomiques candidates.
Grupe Andrew
Peltz Gary Allen
Usuka Jonathan A.
F. Hoffmann-La Roche Ag
Osler Hoskin & Harcourt Llp
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1604690