System for rapid nucleic acid amplification and detection

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – M

Patent

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Details

C12M 1/40 (2006.01) C12M 1/36 (2006.01) C12M 1/38 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2562517

A system is provided for carrying out rapid nucleic acid amplification or other biological reactions requiring thermal cycling. The system of this invention incorporates at least two heating blocks, each having a groove for receiving a reaction vessel such that only a portion of the outer surface of the walls of the vessel are in direct contact with the heating block. The remaining portion of the outer surface of the walls of the reaction vessel remains exposed to ambient conditions. The reaction vessel comes into contact with only one heating block at a time either by movement of the vessel between the heating blocks or by movement of the heating blocks in relation to the vessel. The system of this invention provides rapid temperature cycling without the need for extended ramping times generally associated with single block designs, which include a single temperature block that is forced to heat and cool. Heating and cooling of the reaction using the system of the present invention is accomplished by the reaction vessel and heating blocks coming into thermal contact and reaching thermal equilibrium. The entire vessel need not be surrounded by the heating block, with at least one side of the vessel partially open to ambient conditions. As a result of the configuration of this system it is readily combined with detection systems, for example, fluorescence detection systems.

La présente invention a trait à un système pour la réalisation d'amplification rapide d'acides nucléiques ou d'autres réaction biologiques nécessitant un cyclage thermique. Le système de l'invention comporte au moins deux unités de chauffage, chacune présentant une rainure pour la réception d'une cuve de réaction de sorte que seulement une portion de la surface extérieure des parois de la cuve sont en contact direct avec l'unité de chauffage. La portion restante de la surface extérieure des parois de la cuve de réaction reste exposée aux condition ambiantes. La cuve de réaction vient en contact avec seulement une unité de chauffage à la fois soit par le déplacement de la cuve entre les unités de chauffage ou par le déplacement des unités de chauffage par rapport à la cuve. Le système de l'invention fournit une variation de températures rapide sans nécessiter de durées prolongées d'accélération généralement associées aux modèles à simple unité, qui comportent une seule unité de chauffage qui doit assurer le réchauffement et le refroidissement. Le réchauffement et le refroidissement de la réaction utilisant le système de la présente invention est réalisé par la cuve de réaction et les unités de chauffage venant en contact thermique et atteignant un équilibre thermique. Il n'est pas nécessaire que l'ensemble de la cuve soit entouré par l'unité de chauffage, avec au moins une face de la cuve partiellement ouverte aux conditions ambiantes. Grâce à cette configuration du système, il est facile de le combiner avec des systèmes de détection, par exemple, des systèmes de détection par fluorescence.

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