Systematic evolution of ligands by exponential enrichment:...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01) A61N 5/00 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01) G01N 33/532 (2006.01) G01N 33/535 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01) C07B 61/00 (2006.01)

Patent

CA 2169535

A method for identifying nucleic acid ligands to target molecules using the SELEX procedure wherein the candidate nucleic acids contain photoreactive groups and nucleic acid ligands identified thereby are claimed. The complexes of increased affinity nucleic acids and target molecules formed in the procedure are crosslinked by irradiation to facilitate separation from unbound nucleic acids. In other methods partitioning of high and low affinity nucleic acids is facilitated by primer extension steps as shown in the figure in which chain termination nucleotides, digestion resistant nucleotides or nucleotides that allow retention of the cDNA product on an affinity matrix are differentially incorporated into the cDNA products of either the high or low affinity nucleic acids and the cDNA products are treated accordingly to amplification, enzymatic or chemical digestion or by contact with an affinity matrix. I

Procédé pour l'identification de ligands d'acide nucléique destinés à des molécules cibles, à l'aide de la procédure SELEX dans laquelle les acides nucléiques potentiels contiennent des groupes photoréactifs et des ligands d'acide nucléique identifiés par ceux-ci. Les complexes d'acides nucléiques d'affinité accrue et de molécules cibles formés par la procédure sont réticulés par irradiation afin de faciliter leur séparation des acides nucléiques non liés. Dans d'autres procédés, la division des acides nucléiques de forte et faible affinité est facilitée par des étapes d'extension d'amorce que représente la figure, dans lesquelles des nucléotides de terminaison de chaîne, des nucléotides résistant à la digestion ou des nucléotides permettant la rétention du produit d'ADNc sur une matrice d'affinité sont incorporés de façon différentielle dans les produits d'ADNc des acides nucléiques de haute ou faible affinité et les produits d'ADNc sont traités de la manière appropriée en vue de l'amplification, de la digestion enzymatique ou chimique ou par contact, avec une matrice d'affinité.

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