Systems and methods for analyzing nanoreporters

C - Chemistry – Metallurgy – 40 – B

Patent

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Details

C40B 20/04 (2006.01) G06F 19/20 (2011.01) C12Q 1/68 (2006.01) C40B 30/04 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/58 (2006.01) C40B 70/00 (2006.01)

Patent

CA 2653095

Methods, computers, and computer program products for detecting the presence of a probe within a sample overlayed on a substrate are provided. The probe comprises a plurality of spatially arranged labels. A data storage module stores a plurality of light images, where each light image has light from the sample at a corresponding wavelength range in a plurality of different wavelength ranges. A label identification module identifies a plurality of labels in the plurality of light images that are proximate to each other on the substrate. A spatial order of the plurality of labels determines a string sequence of the plurality of labels. A probe identification module determines whether the string sequence of the plurality of labels comprises a valid reporter sequence.

L'invention concerne des procédés, des ordinateurs et des progiciels pour détecter la présence d'une sonde à l'intérieur d'un échantillon recouvert sur un substrat. La sonde comprend une pluralité d'étiquettes agencées de manière spatiale. Un module de stockage de données stocke une pluralité d'images lumineuses, chaque image lumineuse ayant une lumière provenant de l'échantillon avec une plage de longueurs d'onde correspondante dans une pluralité de plages de longueurs d'onde différentes. Un module d'identification d'étiquette identifie une pluralité d'étiquettes dans la pluralité d'images lumineuses qui sont à proximité les unes des autres sur le substrat. Un ordre spatial de la pluralité d'étiquettes détermine une séquence d'enchaînement de la pluralité d'étiquettes. Un module d'identification de sonde détermine si la séquence d'enchaînement de la pluralité d'étiquettes comprend une séquence valide de reporteurs.

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