G - Physics – 06 – F
Patent
G - Physics
06
F
G06F 19/24 (2011.01)
Patent
CA 2740879
Techniques for categorizing a test sequence are disclosed. An exemplary technique includes defining and utilizing Position Specific Score Matrices that takes into account dependencies of adjacent positions. An embodiment includes predicting HIV viral tropism with improved specificity and sensitivity. Another embodiment includes subdividing a training data set into a set of data subsets, training a plurality of classifiers based on the data subsets, and taking a vote of the plurality of classifiers. Yet another embodiment relates to weighting, in creating a training set, a specified data point based on a distance from the specified data point to an average of the reference plurality of data points.
La présente invention concerne des techniques de catégorisation dune séquence test. Une technique exemplaire comprend la définition et lutilisation de matrices transformées spécifiques dune position qui prennent en compte les dépendances de positions adjacentes. Un mode de réalisation comprend la prédiction du tropisme viral du VIH avec une spécificité et une sensibilité améliorées. Un autre mode de réalisation comprend la subdivision dun ensemble de données dapprentissage en un ensemble de sous-ensembles de données, l'apprentissage dune pluralité de classifieurs en se basant sur les sous-ensembles de données, et le vote de la pluralité de classifieurs. Encore un autre mode de réalisation concerne la pondération, dans la création dun ensemble dapprentissage, d'un point donnée spécifié en se basant sur une distance du point donnée spécifié à une moyenne de la pluralité de points de données de référence.
Liao Guochun
Zheng Ming
F. Hoffmann-La Roche Ag
Osler Hoskin & Harcourt Llp
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1705629