Trans-splicing mediated imaging of gene expression

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H

Patent

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Details

C07H 21/02 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12N 5/00 (2006.01) C12N 5/02 (2006.01) C12N 15/00 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01) C12N 15/62 (2006.01) C12N 15/63 (2006.01) C12N 15/85 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2477295

The present invention provides methods and compositions for imaging of gene expression in cells. The compositions of the invention include pre- trans~splicing molecules (PTMs) designed to interact with a target precursor messenger RNA molecule (target pre-mRNA) expressed within a cell and mediate a trans~splicing reaction resulting in the generation of a novel chimeric RNA molecule (chimeric RNA) capable of encoding a reporter molecule. The PTMs of the invention are designed to interact with target pre-mRNAs thereby providing a method for detection of target pre-mRNA expression. The methods and compositions of the invention may be utilized to monitor the expression of specific genes within a cell. In instances where specific gene expression is associated with a disease, the present invention provides diagnostic methods and compositions. Such diseases include infectious diseases, proliferative disorders such as cancer, genetic, neurological and metabolic disorders, to name a few. Additionally, the present invention may be used in screening assays to identify compounds capable of modulating gene expression or in assays designed to identify protein/protein interactions. The invention is demonstrated by way of example in which papilloma virus gene expression within a cell was detected using a bioluminescence assay system.

L'invention concerne des méthodes et des compositions d'imagerie de l'expression génique dans des cellules. Les compositions selon l'invention comprennent des molécules de pré-trans-épissage (PTM) conçues pour interagir avec une molécule d'ARN messager précurseur cible (pré-ARNm cible) exprimée dans une cellule et pour induire une réaction de trans-épissage générant une nouvelle molécule d'ARN chimère (ARN chimère) capable de coder pour une molécule rapporteur. Les PTM selon l'invention sont conçues pour interagir avec les pré-ARNm cibles, ce qui permet d'obtenir une méthode de détection de l'expression du pré-ARNm cible. Les méthodes et les compositions selon l'invention peuvent être utilisées pour surveiller l'expression de gènes spécifiques dans une cellule. Dans les cas où une expression génique spécifique est associée à une maladie, l'invention concerne des méthodes et des compositions diagnostiques. Parmi les maladies concernées, on trouve des maladies infectieuses, des troubles prolifératifs tels que le cancer, des troubles génétiques, neurologiques et métaboliques, pour n'en nommer que quelques-uns. De plus, l'invention peut trouver son application dans des tests de criblage permettant d'identifier des composés capables de moduler l'expression génique ou dans des analyses conçues pour identifier des interactions protéine/protéine. L'invention est illustrée par un exemple dans lequel l'expression génique du virus du papillome dans une cellule a été détecté à l'aide d'un système de test de bioluminescence.

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