Transcription factor target gene discovery

Details Transcription factor target gene discovery Transcription factor target gene discovery

C - Chemistry, Metallurgy

12

Q

C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01)

Patent

CA 2419479

The ability to rapidly define transcription factor target genes allows for the study of genetic cascades involved in development, physiology and disease. The presently descibed invention outlines the combination of novel chromosomal immunoprecipitation and molecular biology technologies fot the high-throughput in vico discovery and characterization of both known and unknown transcription factor target genes. Through an application of solid phase support matrices and sequential chromosomal immunoprecipitation in combination with molecular cloning procedures this methodology allows for the rapid, stringent purification from cells and tissues of nucleotide sequences representing targets for regulation by transcription factors. Implementation of the technology described herein will result in the efficient simultaneous characterization of both regulatory element and coding sequence target gene information and will be valuable for assessing genetic hierarchies and developing therapeutics.

L'aptitude à définir rapidement des gènes cibles de facteur de transcription permet d'étudier des cascades géniques intervenant dans le développement, la physiologie et des maladies. Cette invention a trait à l'association d'une nouvelle immunoprécipitation chromosomique et de techniques de biologie moléculaire permettant de découvrir, avec une capacité élevée de découverte, et de caractériser in vivo tant des gènes cibles de facteur de transcription connus qu'inconnus. Dans la mesure où elle utilise des matrices de support en phase solide et une immunoprécipitation chromosomique séquentielle associées à des procédures de clonage moléculaire, cette méthode permet de séparer rapidement et avec rigueur de cellules et de tissus des séquences nucléotidiques représentant des cibles pour régulation par facteurs de transcription. La mise en oeuvre de ces techniques, qui permet de caractériser efficacement et simultanément des informations relatives tant à un élément régulateur qu'à un gène cible de séquence codante, s'avère précieuse s'agissant d'évaluer des hiérarchies géniques et de mettre au point des thérapies.

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