Transfer microdissection

Details Transfer microdissection Transfer microdissection

G - Physics

01

N

G01N 33/50 (2006.01) G01N 1/28 (2006.01) G01N 33/543 (2006.01)

Patent

CA 2415864

The present disclosure concerns methods, systems, and devices for analyzing a biological material, such as a cellular or other specimen. In one disclosed example, the method selectively transfers biomolecules from a target region of interest in a biological sample (such as a tissue section). The transfer may occur, for example, by selectively focally altering a characteristic of a transfer layer adjacent the target region, such that the biomolecules can move through the altered area of the transfer layer. In particular examples, the transfer layer is altered by focally increasing a permeability of the transfer layer, for example by removing a focal portion of the transfer layer, and transporting the biomolecules through the altered region of the transfer layer, to microdissect the biomolecules of interest from the biological sample. In yet other embodiments, the microdissected biomolecules can be applied to an analysis substrate containing an identification molecule, such as a nucleic acid array, layered expression scan, or wells containing antibodies. Transfer microdissection allows biomolecules from regions of interest in the biological specimen to be selectively analyzed. For example, nests of highly atypical or metastatic cells in a tumor section can be analyzed for differential expression of certain proteins.

Cette invention concerne des procédés, des systèmes et des dispositifs permettant d'analyser un matériau biologique, tel qu'un spécimen cellulaire ou autre. Selon un mode de réalisation, la méthode consiste à transférer sélectivement et focalement des biomolécules d'une région cible d'intérêt à un échantillon biologique (tel qu'un fragment de tissu). Pour le transfert, on peut, par exemple, modifier sélectivement une couche de transfert adjacente à la région cible de sorte que la biomolécule puisse traverser la zone modifiée de la couche de transfert. Dans des exemples particuliers, on modifie la couche de transfert en en augmentant focalement la perméabilité, par exemple en retirant une partie focale de la couche de transfert et en transportant des biomolécules au travers de la région modifiée de manière à pouvoir séparer par microdissection des molécules d'intérêt de l'échantillon biologique. Selon d'autres modes de réalisation, les biomolécules soumises à microdissection peuvent être appliquées sur un substrat d'analyse renfermant une molécule d'identification, tel qu'un jeu d'acides nucléiques, un champ de balayage d'expression en couche, ou des puits renfermant des anticorps. La microdissection de transfert permet d'analyser sélectivement des biomolécules extraites de régions d'intérêt. Il est par exemple possible de déterminer l'expression différentielle de certaines protéines par l'analyse de nids de cellules fortement atypiques ou métastatiques dans une partie de tumeur.

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