Translocation and mutant ros kinase in human non-small cell...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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C12N 15/62 (2006.01) C07K 14/74 (2006.01) C07K 16/18 (2006.01) C07K 19/00 (2006.01) C12N 9/12 (2006.01) C12P 21/02 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01)

Patent

CA 2702686

In accordance with the invention, a novel gene translocation, (5q32, 6q22), in human non-small cell lung carcinoma (NSCLC) that results in a fusion proteins combining part of CD74 with Proto- oncogene Tyrosine Protein Kinase ROS Precursor (ROS) kinase has now been identified. The CD74-ROS fusion protein is anticipated to drive the proliferation and survival of a subgroup of NSCLC tumors. The invention therefore provides, in part, isolated polynucleotides and vectors encoding the disclosed mutant ROS kinase polypeptides, probes for detecting it, isolated mutant polypeptides, recombinant polypeptides, and reagents for detecting the fusion and truncated polypeptides. The disclosed identification of the new fusion protein enables new methods for determining the presence of these mutant ROS kinase polypeptides in a biological sample, methods for screening for compounds that inhibit the proteins, and methods for inhibiting the progression of a cancer characterized by the mutant polynucleotides or polypeptides, which are also provided by the invention.

L'invention concerne une nouvelle translocation génique (5q32, 6q22) dans l'épithélioma pulmonaire humain à grandes cellules (NSCLC), qui résulte en une protéine de fusion qui associe une partie de CD74 avec le précurseur ROS de protéine tyrosine kinase proto-oncogène (ROS). Il est prévu que la protéine de fusion CD74-ROS entraîne la prolifération et la survie d'un sous-groupe de tumeurs NSCLC. L'invention concerne par conséquent, d'une part des polynucléotides isolés et des vecteurs qui codent pour les polypeptides kinase ROS mutants décrits, des sondes pour les détecter, des polypeptides mutants isolés, des polypeptides recombinants et des réactifs destinés à détecter la fusion et des polypeptides tronqués. L'identification décrite de la nouvelle protéine de fusion permet de nouveaux procédés de détermination de la présence de ces polypeptides kinase ROS mutants dans un échantillon biologique, des procédés de criblage de composés qui inhibent les protéines et des procédés d'inhibition de la progression d'un cancer caractérisé par les polynucléotides ou polypeptides mutants, qui sont également des objets de l'invention.

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