Universal spacer/energy transfer dyes

Details Universal spacer/energy transfer dyes Universal spacer/energy transfer dyes

C - Chemistry, Metallurgy

07

H

C07H 21/00 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2231475

Fluorescent labels are provided employing energy absorber/donor components and energy acceptor/fluorescer components joined together by a spacer which comprises sugar phosphate monomeric units, particularly ribosyl phosphate monomeric units, where the sugar groups are free of active hydroxyl groups. Particularly, an energy transfer component is substituted at the 5' position of the spacer chain, while the other energy transfer component is substituted at the 1' position of the 3' terminal ribosyl group of the label forming an ET cassette for linking to a nucleic acid sequence with any compositions. By employing combinations of ET components, with a common energy absorber/donor and different fluorescers, one can provide for families of labels which can be tagged to any target molecules and which can be excited at a single wavelength and fluoresce at different wavelength with large Stokes shifts. The compositions find particular application in sequencing.

Des marqueurs fluorescents sont offerts qui font appel à des constituants absorbeurs/donneurs d'énergie et à des constituants accepteurs/émetteurs de fluorescence d'énergie réunis par un séparateur qui comprend des motifs monomères à base de phosphate de glucide, particulièrement de motifs monomères de ribosyle phosphate, où les groupes glucidiques sont exempts de groupes hydroxyle actifs. Plus particulièrement, un constituant de transfert d'énergie (TE) est substitué en position 5' de la chaîne du séparateur, pendant que l'autre constituant de transfert d'énergie est substitué en position 1' du groupe ribosyle terminal 3' du marqueur formant une cassette de TE pour liaison à une séquence d'acide nucléique de composition quelconque. En utilisant des combinaisons de constituants de TE, avec un absorbeur/donneur d'énergie courant et des émetteurs de fluorescence différents, on peut obtenir des familles de marqueurs qui peuvent être attachés à n'importe quelle molécule cible et qui peuvent être excités à une longueur d'onde donnée et être fluorescents à une longueur d'onde différente avec des écarts de Stokes importants. Les compositions trouvent une application particulière dans le domaine du séquençage.

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