C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01)
Patent
CA 2505254
The present invention disclosure provides methods and compositions for a universal tag assay wherein a universal detector having detection probes is incubated with tagged molecules having identifier tags corresponding to targets, and hybridization of an identifier tag to a complementary detection probe indicates the presence of the corresponding target in the material being assayed. In particular, the invention disclosure provides methods and compositions for detecting target nucleotide sequences in a sample by target- dependent manipulations that generate tagged molecules having identifier tags corresponding to target nucleotide sequence, where incubation of tagged molecules with a universal detector having detection probes permits hybridization of identifier tags to complementary detection probes, thereby indicating the presence of the target nucleotide sequence corresponding to each identifier tag. Preferred embodiments include use of the universal tag assay for detecting variant sequences including single nucleotide polymorphisms (SNPs), allelic variants, and splice variants. Preferred embodiments further include the use of ruthenium amperometry to detect hybridization of tagged DNA or RNA molecules to detection probes immobilized on a universal detector, preferably a universal chip having gold or carbon electrodes.
La présente invention concerne des procédés et des compositions destinées à un essai de marqueur universel. En l'occurrence, un détecteur universel à sondes de détection est mis à incuber avec des molécules marquées portant des marqueurs d'identification correspondant à ces cibles, l'hybridation d'un marqueur d'identification avec une sonde de détection complémentaire venant indiquer la présence de la cible correspondante dans le matériau en cours d'essai. En l'espèce, l'invention concerne des procédés et des compositions servant à détecter dans un échantillon des séquences de nucléotides cibles par des manipulations liées aux cibles générant des molécules marquées portant des marqueurs d'identification correspondant à la séquence de nucléotides cibles. Dans ce cas, l'incubation de molécules marquées avec un détecteur universel à sondes de détection permet l'hybridation de marqueurs d'identification avec des sondes de détection complémentaires, ce qui indique la présence de la séquence de nucléotides cibles correspondant à chaque marqueur d'identification. Des modes de réalisation préférés de l'invention font intervenir un essai de marqueur universel permettant de détecter des séquences de variantes porteuses de polymorphisme de nucléotide unique (SNP), de variantes allèles, et de variantes à épissures. Des modes de réalisation préférés de l'invention font en outre intervenir un recours à l'ampérométrie au ruthénium pour détecter l'hybridation de molécules marquées d'ADN ou d'ARN avec des sondes de détection immobilisées sur un détecteur universel, de préférence un microcircuit à électrodes d'or ou de carbone.
Crothers Donald M.
Holmlin R. Erik
Borden Ladner Gervais Llp
Geneohm Sciences
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1740127