C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2341483
The invention provides arrays of polynucleotide probes having at least one pooled position. A typical array comprises a support having at least three discrete regions. A first region bears a pool of polynucleotide probes comprising first and second probes. A second region bears the first probe without the second probe and a third region bears the second probe without the first probe. A target nucleic acid having segments complementary to both the first and second probes shows stronger normalized binding to the first region than to the aggregate of binding to the second and third regions due to cooperative binding of pooled probes in the first region. The invention provides methods of using such arrays for e.g., linkage analysis, sequence analysis, and expression monitoring.
La présente invention concerne des séries de sondes polynucléotidiques avec au moins une position groupée. Une série type comprend un support présentant au moins trois régions discrètes. Une première région porte un groupe de sondes polynucléotidiques composées de premières et de secondes sondes. Une deuxième région porte la première sonde sans la seconde sonde, et une troisième région la seconde sonde sans la première sonde. Un acide nucléique cible présentant des segments complémentaires à la fois des premières et des secondes sondes affiche avec la première région une fixation normalisée plus forte que l'agrégat de fixation avec les deuxième et troisième régions compte tenu de la fixation coopérative de coopération des sondes groupées de la première région. L'invention concerne diverses méthodes d'utilisation de telles séries, notamment pour l'analyse de liaison, l'analyse de séquence et la surveillance d'expression.
Chee Mark
Gentalen Erik
Affymetrix Inc.
Smart & Biggar
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1410745