Whole cell engineering by mutagenizing a substantial portion...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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C12N 15/00 (2006.01) C12N 15/09 (2006.01) C12Q 1/02 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) G01N 27/447 (2006.01) G01N 27/62 (2006.01) G01N 30/88 (2006.01) G01N 33/483 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/566 (2006.01) G01N 33/58 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01) G01N 37/00 (2006.01) A01H 1/00 (2006.01) A01K 67/027 (2006.01)

Patent

CA 2424178

An invention comprising cellular transformation, directed evolution, and screening methods for creating novel transgenic organisms having desirable properties. In one embodiment, this invention provides a method of generating a transgenic organism, such as a microbe or a plant, having a plurality of traits that are differentially activatable. This invention also provides a method of retooling genes and gene pathways by the introduction of regulatory sequences, such as promoters, that are operable in an intended host, this conferring operability to a novel gene pathway when it is introduced into an intended host. For example a novel man-made gene pathway, generated based on microbially-derived progenitor templates, that is operable in a plant cell. This invention also provides a method of generating novel host organisms having increased expression of desirable traits, recombinant genes, and gene products. This invention provides novel methods for determining polypeptide profiles, and protein expression variations, which methods are applicable to all sample types disclosed herein. The present invention provides methods of simultaneously identifying and quantifying individual proteins in complex protein mixtures. Additionally this invention provides methods for cellular and metabolic engineering of new and modified phenotypes by using "on-line" or "real-time" metabolic flux analysis.

L'invention concerne des procédés de transformation cellulaire, d'évolution dirigée et de criblage utiles pour produire de nouveaux organismes transgéniques possédant des propriétés voulues. Dans une forme de réalisation, l'invention concerne un procédé de production d'organisme transgénique, tel qu'un microbe ou une plante, comportant une pluralité de caractéristiques activables de manière différenciée. L'invention concerne aussi un procédé de remaniement de gènes et de voies géniques par l'introduction de séquences régulatrices, tels des promoteurs, qui peuvent être activées chez un hôte voulu et sont ainsi capables de conférer une capacité d'activation à une nouvelle voie génique après introduction de celle-ci dans un hôte voulu; par exemple, une nouvelle voie génique artificielle, produite sur la base de modèles de progéniteurs dérivés de microbes, qui peut être activée dans une cellule végétale. Cette invention concerne aussi un procédé de production de nouveaux organismes hôtes possédant une expression accrue de caractéristiques voulues, de gènes recombinés et de produits géniques; de nouveaux procédés servant à déterminer des profils de polypeptides et des variations d'expression de protéines, ces procédés pouvant être appliqués à tous les types d'échantillons décrits; des procédés permettant d'identifier et de quantifier simultanément des protéines individuelles dans des mélanges complexes de protéines. De plus, l'invention concerne des procédés de mise au point cellulaire et métabolique de nouveaux phénotypes modifiés utilisant une analyse de flux métabolique <= en ligne >= ou <= en temps réel >=.

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