Zinc finger protein derivatives and methods therefor

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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C12N 15/01 (2006.01) A61K 38/16 (2006.01) A61K 38/17 (2006.01) C07K 14/00 (2006.01) C07K 14/005 (2006.01) C07K 14/435 (2006.01) C07K 14/47 (2006.01) C07K 19/00 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01) C12N 15/12 (2006.01) C12N 15/33 (2006.01) C12N 15/62 (2006.01) C12N 15/70 (2006.01) C12Q 1/02 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01) G01N 33/569 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01) A61K 38/00 (2006.01)

Patent

CA 2291861

Zinc finger proteins of the Cys2His2 type represent a class of malleable DNA binding proteins which may be selected to bind diverse sequences. Typically, zinc finger proteins containing three zinc finger domains, like the murine transcription factor Zif268 and the human transcription factort Sp1, bind nine contiguous base pairs (bp). To create a class of proteins which would be generally applicable to target unique sites within complex genomes, the present invention provides a polypeptide linker that fuses two three-finger proteins. Two six-fingered proteins were created and demonstrated to bind 18 contiguous bp of DNA in a sequence specific fashion. Expression of these proteins as fusions to activation or repression domains allows transcription to be specifically up or down modulated within cells. Polydactyl zinc finger proteins are broadly applicable as genome-specific transcriptional switchhes in gene therapy strategies and the development of novel transgenic plants and animals. Such proteins are useful for inhibiting, activating or enhancing gene expression from a zinc finger-nucleotide binding motif containing promoter or other transcriptional control element, as well as a structural gene or RNA sequence.

L'invention concerne des protéines à doigts de zinc du type Cys¿2?His¿2?, qui représentent une classe de protéines malléables fixatrices d'ADN pouvant être sélectionnées en vue d'une fixation à diverses séquences. Généralement, les protéines à doigts de zinc contenant trois domaines de doigts de zinc, tel le facteur de transcription murin Zif268 et le facteur de transcription humain Sp1, se fixent à neuf paires de bases contiguës. En vue de créer une classe de protéines qui serait applicable de manière générale à des sites cibles uniques dans des génomes complexes, la présente invention prévoit un lieur polypeptidique qui permet de fusionner deux protéines à trois doigts. Deux protéines à six doigts ont été produites, dont il a été prouvé qu'elles se lient à 18 paires de bases de l'ADN de façon spécifique par rapport aux séquences. L'expression de ces protéines de fusion du point de vue des domaines d'activation ou de répression permet de moduler la transcription de manière spécifique vers le haut ou vers le bas dans des cellules. Des protéines polydactyles à doigts de zinc trouvent de nombreuses applications comme commutateurs de transcription spécifiques de génome dans des stratégies de thérapie génique, et dans le développement de nouvelles plantes et animaux transgéniques. Ces protéines sont utiles pour inhiber, activer ou améliorer l'expression génique à partir d'un motif de fixation de nucléotides à doigts de zinc contenant un promoteur ou un autre élément de commande de transcription, ainsi qu'un gène de structure ou une séquence d'ARN.

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