Super humanized antibodies

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – K

Patent

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Details

C07K 16/46 (2006.01) A61K 39/395 (2006.01) C07K 16/00 (2006.01) C12N 15/00 (2006.01)

Patent

CA 2491864

Disclosed herein are methods for humanizing antibodies based on selecting variable region framework sequences from human antibody genes by comparing canonical CDR structure types for CDR sequences of the variable region of a non-human antibody to canonical CDR structure types for corresponding CDRs from a library of human antibody sequences, preferably germline antibody gene segments. Human antibody variable regions having similar canonical CDR structure types to the non-human CDRs form a subset of member human antibody sequences from which to select human framework sequences. The subset members may be further ranked by amino acid similarity between the human and the non- human CDR sequences. Top ranking human sequences are selected to provide the framework sequences for constructing a chimeric antibody that functionally replaces human CDR sequences with the non- human CDR counterparts using the selected subset member human frameworks, thereby providing a humanized antibody of high affinity and low immunogenicity without need for comparing framework sequences between the non-human and human antibodies. Chimeric antibodies made according to the method are also disclosed.

L'invention a trait à des procédés destinés à humaniser des anticorps, qui s'appuient sur la sélection de séquences d'infrastructure de régions variables issues de gènes d'anticorps humanisés, effectuée par la comparaison des types de structure CDR (régions hypervariables) canonique de séquences CDR de la région variable d'un anticorps non humain aux types de structure CDR canonique de CDR correspondantes provenant d'une banque de séquences d'anticorps humains, de préférence de segments géniques d'anticorps de lignée germinale. Les régions variables d'anticorps humains qui possèdent des types de structure CDR canonique similaires aux CDR non humaines forment un sous-ensemble d'éléments séquences d'anticorps humains, dans lequel les séquences d'infrastructure humaine doivent être sélectionnées. Les éléments du sous-ensemble peuvent être classés également selon la similarité des acides aminés entre les séquences CDR humaines et non humaines. Les séquences humaines à la tête du classement sont sélectionnées pour fournir les séquences d'infrastructure qui permettent de construire un anticorps chimérique remplaçant de manière fonctionnelle des séquences CDR humaines par des homologues CDR non humains faisant appel aux infrastructures humaines des éléments du sous-ensemble sélectionné, ce qui permet d'obtenir un anticorps humanisé à forte affinité et faible immunogénicité, sans qu'il soit nécessaire de comparer les séquences d'infrastructure des anticorps non humains et humains. L'invention concerne également des anticorps chimériques produits selon ledit procédé.

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