C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
07
H
C07H 21/02 (2006.01) C07H 19/06 (2006.01) C07H 19/10 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C25B 1/00 (2006.01)
Patent
CA 2368581
Methods and compositions are provided for detecting DNA sequences, particularly single nucleotide polymorphisms, using a pair of nucleotide sequences, a primer and a snp detection sequence, where the snp detection sequence binds downstream from the primer to the target DNA in the direction of primer extension. The snp detection sequence is characterized by having a nucleotide complementary to the snp and adjacent nucleotides complementary to adjacent nucleotides in the target and an electrophoretic tag bonded to the 5'- nucleotide. The pair of sequences is combined with the target DNA under primer extension conditions, where the polymerase has 5'-3' exonuclease activity. When the snp is present, the electrophoretic tag is released and can be detected by electrophoresis as indicative of the presence of the snp in the target DNA. The sequence containing the snp is exemplary of DNA sequences of interest generally.
Cette invention se rapporte à des procédés et à des compositions servant à détecter des séquences d'ADN, en particulier des polymorphismes nucléotidiques simples (pns) en utilisant une paire de séquences nucléotidiques, une amorce et une séquence de détection de pns, laquelle se fixe en aval de l'amorce à l'ADN cible dans la direction d'extension de l'amorce. La séquence de détection de pns se caractérise par un nucléotide complémentaire du pns et par des nucléotides adjacents complémentaires de nucléotides adjacents de la cible, ainsi que par un indicateur électrophorétique fixé au nucléotide 5'. Ladite paire de séquences est combinée à l'ADN cible dans des conditions d'extension de l'amorce, dans lesquelles la polymérase possède une activité d'exonucléase 5'-3'. Lorsque le pns est présent, l'indicateur électrophorétique est libéré et peut être détecté par électrophorèse comme révélateur de la présence du pns dans l'ADN cible. La séquence contenant le pns est exemplaire des séquences d'ADN d'intérêt, de façon générale.
Aclara Biosciences Inc.
Gowling Lafleur Henderson Llp
LandOfFree
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