Method to identify gene function using small molecule probes

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C - Chemistry, Metallurgy

12

Q

C12Q 1/00 (2006.01) A61K 38/00 (2006.01) C12N 7/00 (2006.01) C12N 15/00 (2006.01) C12N 15/09 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01) C12N 15/63 (2006.01) C12N 15/70 (2006.01) C12N 15/74 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/543 (2006.01)

Patent

CA 2383186

Methods for identifying genes which bind to natural products and other small molecules using a phage display system are described. Phage displaying protein which binds the target molecule are selected by affinity chromatography using a solid support to which a small molecule non-peptide bait is coupled. The selectively bound phage can then be amplified and the DNA inserts encoding the binding protein sequenced. The specifically bound protein is then useful to screen for therapeutic candidates which can then be used to treat conditions modulated by the target protein.

La présente invention concerne des techniques permettant d'identifier des gènes qui se lient à des produits naturels et à d'autres petites molécules par l'utilisation d'un système d'expression à la surface des phages. On sélectionne les phages d'expression de protéine qui se lient avec la molécule cible par chromatographie d'affinité en utilisant un support solide sur lequel une petite molécule appât non peptide est couplée. La phage liée sélectivement peut ensuite être amplifiée et les inserts d'ADN codant pour la protéine de liaison peuvent être séquencés. Cette protéine spécifiquement liée est ensuite utile pour rechercher des candidats thérapeutiques qui peuvent ensuite être utilisés pour traiter des états modulés par la protéine cible.

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