C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C07K 14/47 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01)
Patent
CA 2431047
Methods for determining one or more biological effects of a compound on gene expression are described. These methods involve obtaining a nuclear extract from cells exposed to a compound and then combining the nuclear extract with a nucleic acid, or library of nucleic acids, containing one or more regulatory elements under conditions that allow formation of cis/trans complexes between the regulatory elements and components (e.g., DNA binding proteins) of the nuclear extract. The complexes so formed are then compared with complexes formed using nuclear extracts obtained the same but untreaed cells and the compound. Differences between the comlexes formed as a result of exposure of teh cells to the compound can then be assessed. The methods of th einvention are preferably carried out in a high throughput format, and are useful, for example, to assess efficacy, toxicity, and mechanism of action of a compound. Accordingly, the invention will be useful in developing new drugs, and in better understanding and improving compounds already in use or under development.
L'invention concerne des procédés de détermination d'un ou plusieurs effets biologiques d'un composé sur l'expression génétique. Ces procédés consistent à obtenir un extrait nucléaire de cellules exposé à un composé, puis à combiner cet extrait avec un acide nucléique, ou une librairie d'acides nucléiques, contenant un ou plusieurs éléments régulateurs dans des conditions permettant la formation de complexes cis/trans entre les éléments régulateurs et les composants (par ex., les protéines de liaison d'ADN) de l'extrait nucléaire. Les complexes ainsi formés sont comparés aux complexes formés au moyen des extraits nucléaires obtenus de la même manière, mais dont les cellules n'ont pas été traitées, et au composé. Les différences entre les complexes formés après exposition des cellules au composé peuvent ensuite être évaluées. Les procédés de l'invention sont, de préférence, exécutés dans une configuration à débit élevé, et sont utiles, par exemple, afin d'évaluer l'efficacité, la toxicité, et le mécanisme d'action d'un composé. Par ailleurs, cette invention sera utile dans la mise au point de nouveaux médicaments, et dans la meilleure compréhension et amélioration de composés déjà utilisés ou en cours de mise au point.
Adams Christopher C.
Harper Mary E.
Labhart Paul
Adams Christopher C.
Cistem Molecular Corporation
Gowling Lafleur Henderson Llp
Harper Mary E.
Labhart Paul
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1438812