C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C07K 16/08 (2006.01) C07K 16/12 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/566 (2006.01) G01N 33/569 (2006.01) C12P 21/08 (2006.01)
Patent
CA 2431646
A method of detecting in a subject, the occurrence of a base-specific intracellular binding event involving a single-stranded target RNA, is disclosed. The method includes administering to the subject an oligomeric antisense compound having (i) from 8 to 40 bases, including a targeting base sequence that is complementary to a portion of the target RNA, (ii) a Tm, with respect to binding to a complementary RNA sequence, of greater than about 50 ~C, and (iii) an ability to be actively taken up mammalian cells, and (iv) conferring resistance of complementary RNA hybridized with the agent to RnaseH. Where the compound is administered in uncomplexed form, it preferably has a substantially backbone. At a selected time after said administering the agent, a sample of a body fluid is obtained from the subject, and the presence in the sample of a nuclease-resistant heteroduplex composed of the antisense oligomer and the complementary portion of the target RNA is detected. The method is useful, for example, for detecting levels of gene expression, biochemical or physiological states that are characterized by expression of certain genes, genetic mutation, and the presence and identity of infective viral or bacterial agents. Also disclosed are arrays, kits and antibodies employed in carrying out the method.
La présente invention concerne une méthode qui permet de détecter chez un individu, l'occurrence d'un événement de liaison intracellulaire à spécificité de base impliquant un ARN cible simple brin. La méthode consiste à administrer à l'individu un composé antisens oligomère comprenant (i) de 8 à 40 bases, y compris une séquence de bases de ciblage qui est complémentaire à une partie de l'ARN cible, présentant (ii) une Tm, qui est supérieure à environ 50 ·C, par rapport à la liaison à une séquence d'ARN complémentaire, et (iii) une aptitude pour être activement captée par les cellules de mammifère, et (iv) conférant une résistance d'ARN complémentaire hybridé avec l'agent à RnaseH. Lorsque le composé est administré sous une forme non complexée, il a de préférence un squelette substantiel. Après un temps déterminé suite à l'administration de l'agent, on prélève sur l'individu un échantillon de fluide corporel et on détecte la présence, dans l'échantillon, d'un hétéroduplex résistant aux nucléases composé de l'oligomère antisens et de la partie complémentaire de l'ARN cible. Cette méthode est utile, par exemple, pour détecter des niveaux de l'expression génique, des états biochimiques ou physiologiques qui sont caractérisés par l'expression de certains gènes, par une mutation génétique et par la présence et l'identité d'agents infectieux de nature virale ou bactérienne. La présente invention concerne également des jeux ordonnés d'échantillons, des trousses et des anticorps employés dans ladite méthode.
Avi Biopharma Inc.
Gowling Lafleur Henderson Llp
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1454323