A method for in vitro molecular evolution of protein function

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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C12N 15/10 (2006.01) C07K 16/00 (2006.01) C07K 16/10 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2278585

The present invention relates to a method for in vitro creation of molecular libraries evolution of protein function. Particularly, it relates to variability and modification of protein function by shuffling polynucleotide sequence segments. A protein of desired characteristics can be obtained by incorporating variant peptide regions (variant motifs) into defined peptide regions (scaffold sequence). The variant motifs can be obtained from parent DNA which has been subjected to mutagenesis to create a plurality of differently mutated derivatives thereof or they can be obtained from in vivo sequences. These variant motifs can then be incorporated into a scaffold sequence and the resulting coded protein screened for desired characteristics. This method is ideally used for obtaining antibodies with desired characteristics by isolating individual CDR DNA sequences and incorporating them into a scaffold which may, for example, be from a totally different antibody.

La présente invention concerne un procédé destiné à créer in vitro une évolution de la fonction protéine à partir d'une banque moléculaire. L'invention concerne en particulier la variabilité et la modification de la fonction protéique par la distribution aléatoire des segments de séquence polynucléotide. On peut obtenir une protéine présentant les caractéristiques voulues en incorporant des régions peptidiques de variants (motifs de variants) dans des régions peptidiques délimitées (séquence support). On peut obtenir lesdits motifs de variants à partir d'un ADN parent ayant été soumis à une mutagenèse afin de créer une multiplicité de dérivés différemment mutés de cet ADN; on peut également obtenir ces dérivés à partir de séquences in vivo. On peut ensuite incorporer les motifs de variants dans une séquence support, la protéine codée ainsi obtenue étant passée au crible afin de déterminer les caractéristiques voulues. Idéalement, ce procédé est utilisé pour obtenir des anticorps présentant les caractéristiques voulues, grâce à l'isolement de séquences individuelles d'ADN CDR et à l'incorporation de ces séquences dans un support provenant, par exemple, d'un anticorps totalement différent.

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