Structured synthetic antigen libraries as diagnostics,...

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – K

Patent

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C07K 14/00 (2006.01) A61K 39/00 (2006.01) C07K 1/04 (2006.01) C07K 7/04 (2006.01) C07K 7/06 (2006.01) C07K 14/02 (2006.01) C07K 14/11 (2006.01) C07K 14/12 (2006.01) C07K 14/15 (2006.01) C07K 14/16 (2006.01) C07K 14/18 (2006.01) C07K 14/20 (2006.01) C07K 14/295 (2006.01) C07K 14/315 (2006.01) C07K 14/44 (2006.01) C07K 14/705 (2006.01) C07K 14/74 (2006.01) C07K 14/78 (2006.01) G01N 33/564 (2006.01) G01N 33/569 (2006.01) A61K 38/00 (2006.01)

Patent

CA 2175579

The present invention relates to "structured synthetic antigen libraries" (SSAL) composed of related peptides synthesized simultaneously in a single peptide synthesis. This "stuctured" library contrasts to those libraries previously described as "random peptide libraries" in that the order or structure within a synthetic antigen is provided by invariant amino acid residues that define the framework sequence of the synthetic antigen. The specific amino acids and their frequency of appearance at a variant locus within aligned peptide sequences is defined by the primary sequences of the several variants that make up the alignment used to construct the antigen peptide library. A method of constructing an open diagnostic, vaccine or therapeutic for a mutational infectious agent is also provided. The invention further provides the SSAL in diagnostic methods, kits vaccination methods, vaccine compositions and pharmaceutical compositions. The libraries are prepared from variable domains in proteins and provide improved vaccines, diagnostics and therapeutics for infectious agents, etc., from such proteins.

La présente invention concerne les bibliothèques structurées d'antigènes de synthèse ou "SSAL" (Structured Synthetic Antigen Libraries) composées de peptides synthétisés simultanément en une seule synthèse peptidique. La différence entre la bibliothèque "structurée" et les anciennes bibliothèques dites "bibliothèques aléatoires de peptides" est que désormais l'ordre ou la structure interne de l'antigène de synthèse est constitué par des résidus d'acides aminés invariants qui définissent la séquence squelette de l'antigène de synthèse. Les acides aminés spécifiques et leur fréquence d'occurrence à un locus de variant dans une séquence peptidique alignée sont définis par rapport aux séquences primaires de plusieurs variants constituant l'alignement utilisé pour la réalisation de la bibliothèque de peptides. Est également décrit un procédé d'élaboration d'un agent diagnostique, d'un vaccin ou d'un agent thérapeutique à large spectre pour un agent infectieux en mutation. L'invention concerne également l'utilisation des SSAL pour des procédés de diagnostics, des kits, des procédés de vaccination, des compositions vaccinales et des compositions pharmaceutiques. Ces bibliothèques, qui sont élaborées à partir de domaines variables des protéines, permettent, à partir de telles protéines, la réalisation de meilleurs vaccins, de meilleurs agents diagnostiques et de meilleurs moyens thérapeutiques adaptés aux agents infectieux notamment.

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