Porphyrin labeling of polynucleotides

Details Porphyrin labeling of polynucleotides Porphyrin labeling of polynucleotides

C - Chemistry, Metallurgy

07

H

C07H 19/04 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/533 (2006.01)

Patent

CA 2202480

The invention provides various porphyrin labeled compounds and reagents for labeling molecules with porphyrins. The porphyrin labeled compounds include porphyrin labeled nucleosides, nucleotides, polynucleotides and the like. The porphyrin labeled compounds of the invention are designed so that the porphyrin moiety on the labeled compound may be detected on the basis of a reaction product produced by the porphyrin catalyzed oxidation of a porphyrin detection reagent. The oxidation of the porphyrin detection reagent may result in the formation of light, i.e., a chemiluminescent reaction, or a colored compound, i.e., a colorimetric reaction. The compounds of the invention contain the general structure of: porphyrin-linker-base-sugar-(phos)n-OH. Another aspect of the invention is to provide methods of labeling and detecting polynucleotides by incorporating a porphyrin-labeled nucleotide into a polynucleotide.

L'invention concerne divers composés marqués par porphyrines et des réactifs utilisés pour marquer des molécules à l'aide de porphyrines. Ces composés marqués par porphyrines sont, entre autres, les nucléosides, les nucléotides, les polynucléotides marqués par porphyrines et similaire. Les composés marqués par porphyrines selon l'invention sont conçus pour que la fraction de porphyrines sur le composé marqué puisse être détectée à partir d'un produit de réaction produit par oxydation catalysée des porphyrines d'un réactif de détection de porphyrines. L'oxydation du réactif de détection de porphyrines peut induire la formation de lumière, soit une réaction chimioluminescente, ou d'un composé coloré, soit une réaction colorimétrique. Les composés selon l'invention présentent la structure générale suivante: porphyrines-segment de liaison-base-sucre-(phos)¿n?-OH. Dans un autre aspect, l'invention concerne des procédés de marquage et de détection de polynucléotides par l'insertion d'un nucléotide marqué par porphyrines dans un polynucléotide.

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