Method for validating/invalidating target(s) and pathways

A - Human Necessities – 61 – K

Patent

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A61K 31/70 (2006.01) A61K 48/00 (2006.01) A61K 49/00 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01) C12N 15/63 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) A61K 38/00 (2006.01)

Patent

CA 2366055

A method of determining the existence of a correlation between a function of a disease or condition and a gene or mRNA encoding a target polypeptide suspected of being associated with a disease or condition, comprises obtaining oligonucleotides (oligos) consisting of up to about 15 % adenosine (A), preferably having no adenosine content, and which is anti-sense to a target selected from the group consisting of target genes and their corresponding mRNAs, genomic and mRNA flanking regions selected from the group consisting of 3' and 5' intron-exon borders and the juxta-section between coding and non- coding regions, and all mRNA segments encoding polypeptides associated with a pre-selected disease or condition; selecting amongst the oligos one that significantly inhibits or ablates expression of the polypeptide encoded by the mRNA upon in vitro hybridization to the target mRNA; administering to a subject an amount of the selected oligo effective for in vivo hybridization to the target mRNA; and assessing a subject=s function that is associated with the disease or condition before and after administration of the oligo; wherein a change in the function=s value greater than about 70 % indicates a positive correlation, between about 40 and about 70 % a possible correlation, and below about 30 % a lack of correlation. The present method preferably administers the oligos in situ where the target is located, e.g. into the subject=s respiration when validating targets associated with malignant and other pulmonary and respiratory functions, so that the agent has direct access to the lungs. Alternatively, such desAdenosine oligos may be delivered directly to the CNS or other organs, tissues and organ systems, by means of known delivery formulations.

La présente invention concerne un procédé pour déterminer l'existence d'une corrélation entre une fonction et une affection ou un état pathologique et un gène ou un ARNm codant un polypeptide cible présumé d'être associé à une affection ou à une condition, qui consiste à: disposer d'oligonucléotides (oligos) comprenant au plus environ 15 % d'adénosine (A), de préférence ne contenant pas d'adénosine, et qui est un antisens à la cible sélectionnée dans le groupe constitué des gènes cibles et leurs ARNm correspondants, les régions génomiques et les régions flanquantes de l'ARNm sélectionnées dans le groupe constitué des frontières intron-exon 3' et 5' et la section de juxtaposition entre les régions codantes et non codantes, et tous les segments de l'ARNm codant des polypeptides associés à une affection ou à une condition prédéterminée; sélectionner parmi les oligos un qui présente une activité d'inhibition ou d'ablation notable vis-à-vis de l'expression d'un polypeptide codé par le ARNm lors d'une hybridation in vitro à l'ARNm cible; administrer à un sujet une quantité efficace d'oligo sélectionné pour une hybridation in vivo à l'ARNm cible; et évaluer une fonction sujet=s qui est associée à l'affection ou la condition avant et après l'administration de l'oligo; dans lequel une modification dans la valeur de la fonction=s supérieure à environ 70 % signifie une corrélation positive, entre environ 40 et environ 70 % une corrélation possible, et inférieure à 30 % un manque de corrélation. De préférence, ledit procédé effectue l'administration des oligos in situ où la cible est localisée, par exemple dans le système respiratoire du sujet=s lors d'une validation de cibles associées à des fonctions malignes et autres fonctions pulmonaires et respiratoires, de sorte que l'agent peut accéder directement aux poumons. Alternativement, de telles adénosines (desA) peuvent être délivrées directement au système central nerveux ou à d'autres organes, systèmes de tissus ou d'organes, au moyen de formulations d'administration connues.

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