C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2406140
The present invention concerns methods for measuring drug resistance by correlating genotypic information with phenotypic profiles. In one embodiment, a method for interpreting genotypic information is described wherein a genetic code is generated from a patient sample, a list of mutations known or suspect to play a role in the development of resistance to one or more drugs is obtained from the generated genetic code, a genotype database is interrogated for previous samples with similar mutations relating to said one or more drugs, a phenotype for said samples is located in a phenotype database, the mean change in inhibition is determined based on all the examples located in said phenotype database, and a phenotype is determined for the patients sample. Furthermore, methods are provided for predicting a phenotype from a biological sample and for predicting drug or therapy resistance of a patient, a pathogen or a malignant cell. Also methods and systems are provided for designing, optimizing and assessing the efficiency of a therapeutic regimen based upon the genotype of the disease affecting the patient.
L'invention concerne des procédés de mesure de la résistance aux médicaments par corrélation d'informations génotypiques avec des profils phénotypiques. Dans un mode de réalisation, l'invention concerne un procédé d'interprétation d'informations génotypiques. Ce procédé consiste à créer un code génétique à partir d'un prélèvement de patient; à obtenir, à partir de ce code génétique, une liste de mutations connues ou suspectées de jouer un rôle dans le développement de la résistance à au moins un médicament; à interroger une base de données génotypiques sur des prélèvements antérieurs présentant des mutations similaires se rapportant à au moins un de ces médicaments; à localiser un phénotype desdits prélèvements dans une base de données phénotypiques; à déterminer le changement moyen au niveau de l'inhibition sur la base de tous les exemples localisés dans la base de données phénotypiques; et à déterminer un phénotype pour le prélèvement de patient. De plus, l'invention traite de procédés de prédiction d'un phénotype à partir d'un prélèvement biologique et de la résistance d'un patient, d'un pathogène ou d'une cellule maligne à un médicament ou à une thérapie. L'invention concerne enfin des procédés et des systèmes de conception, d'optimisation et d'évaluation de l'efficacité d'un schéma posologique fondé sur le génotype de la maladie affectant le patient.
Bloor Stuart
Dehertogh Pascale Alfons Rosa
Hertogs Kurt
Larder Brendan
Mortier Rudy Jean Marc
Gowling Lafleur Henderson Llp
Virco Bvba
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1735188