High throughput method for functionally classifying proteins...

C - Chemistry – Metallurgy – 40 – B

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C40B 20/04 (2006.01) C12Q 1/00 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/533 (2006.01) G01N 33/542 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01) G01N 37/00 (2006.01)

Patent

CA 2309345

The present invention provides a method for functionally classifying a protein that is capable of unfolding due to a thermal change. The method comprises screening one or more of a multiplicity of different molecules for their ability to shift the thermal unfolding curve of the protein, wherein a shift in the thermal unfolding curve indicates that the molecule binds to the protein or affects the stability in a measurable way; generating an activity spectrum for the protein wherein the activity spectrum reflects a set of molecules, from the multiplicity of molecules, that shift the thermal unfolding curve, of the protein and therefore are ligands that bind to the protein, comparing the activity spectrum for the protein to one or more functional reference spectrum lists; and classifying the protein according to the set of molecules in the multiplicity of different molecules that shift the thermal unfolding curve of the protein.

Cette invention a trait à un procédé à haut rendement permettant de classer fonctionnellement une protéine capable de se déplier sous l'effet d'un changement d'ordre thermique. Ce procédé, qui consiste à cribler l'une, sinon plusieurs, des multiplicités de molécules différentes aux fins de la détermination de leur aptitude à décaler la courbe thermique de dépliage de la protéine, un décalage de cette courbe indiquant que la molécule se fixe à la protéine ou influe sur sa stabilité de façon mesurable, consiste également à générer un spectre d'activité de la protéine, spectre qui correspond à un ensemble de molécules de la protéine, ces molécules étant issues de la multiplicité susmentionnée décalant la courbe thermique de dépliage et étant, de ce fait, des ligands qui se fixent à la protéine. On compare ensuite, dans le cadre de ce procédé, le spectre d'activité relatif à la protéine à une liste de spectres de référence fonctionnels, sinon à plusieurs, et l'on classe la protéine d'après l'ensemble de molécules de la multiplicité de molécules différentes qui décalent la courbe thermique de dépliage de la protéine.

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