Nrps-pks gene cluster and its manipulation and utility

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

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C12N 15/52 (2006.01) C07D 225/02 (2006.01) C12N 1/20 (2006.01) C12N 15/00 (2006.01) C12N 15/63 (2006.01) C12P 17/10 (2006.01) C07K 14/36 (2006.01)

Patent

CA 2718429

The present invention provides a nucleic acid molecule comprising: (a) a nucleotide sequence as shown in SEQ ID No. 1; or (b) a nucleotide sequence which is the complement of SEQ ID No. 1; or (c) a nucleotide sequence which is degenerate with SEQ ID No. 1; or (d) a nucleotide sequence having at least 85% sequence identity (preferably at least 87%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% sequence identity) with SEQ ID No. 1; or (e) a part of any one of (a) to (d), wherein said nucleic acid molecule encodes or is a complementary to a nucleic acid molecule encoding one or more polypeptides, or comprises or is complementary to a nucleic acid molecule comprising one or more genetic elements, having functional activity in the synthesis of a polyketide-based or macrolactam molecule. Particularly the invention contemplates the modification of the nucleic acid of the invention, encoding the biosynthetic machinery for the synthesis of the polyketide macrolactam BE- 14106, including expressing in a microorganism the modified nucleic acid molecule. In certain aspects the modification includes introducing, mutating, deleting, replacing or inactivating a sequence encoding one or more activities or proteins encoded by said nucleic acid molecule. Other aspects of the invention include a microorganism containing the modified and unmodified nucleic acid and recovering the polyketide-based or macrolactam molecule from said mircoorganism.

La présente invention concerne une molécule dacide nucléique comprenant : (a) une séquence nucléotidique telle que représentée dans SEQ ID No. 1 ; ou (b) une séquence nucléotidique qui est le complément de SEQ ID No. 1 ; ou (c) une séquence nucléotidique qui est dégénérée avec SEQ ID No. 1 ; ou (d) une séquence nucléotidique présentant une identité de séquence dau moins 85 % (de préférence, une identité de séquence dau moins 87 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 % ou 99 %) avec SEQ ID No. 1 ; ou (e) une partie de lun quelconque des éléments (a) à (d). Ladite molécule dacide nucléique code pour une molécule dacide nucléique codant pour un ou plusieurs polypeptides ou est complémentaire à celle-ci, ou bien comprend ou est complémentaire à une molécule dacide nucléique qui comprend un ou plusieurs éléments génétiques et présente une activité fonctionnelle dans la synthèse dune molécule de macrolactame ou à base de polycétide. En particulier, linvention concerne la modification de lacide nucléique de linvention, codant pour le mécanisme de biosynthèse pour la synthèse du macrolactame polycétide BE-14106, y compris lexpression, dans un microorganisme, de la molécule dacide nucléique modifié. Dans certains aspects, la modification comprend lintroduction, la mutation, la suppression, le remplacement ou linactivation dune séquence codant pour une ou plusieurs activités ou des protéines codées par ladite molécule dacide nucléique. Dautres aspects de linvention comprennent un microorganisme contenant lacide nucléique modifié et non modifié et la récupération de la molécule de macrolactame ou à base de polycétide à partir dudit microorganisme.

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