C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
07
H
C07H 21/00 (2006.01) C07H 21/02 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2348779
Multidomain polynucleotides responsive to signalling agents are designed and constructed to have at least three domains which can be partially or completely overlapping or nonoverlapping: an actuator (catalytic or reporter) domain, a bridging domain, and a receptor domain. In a typical embodiment, a signalling agent such as a chemical ligand interacts with the receptor domain, which changes conformation or otherwise influences the bridging domain so that the activity, catalytic, or reporter function of the actuator domain is stimulated or inhibited. In some ribozyme embodiments, for example, ligand- specific molecular sensors composed of RNA are created by coupling pre- existing catalytic and receptor domains via novel structural bridges which function such that binding of a ligand to the receptor domain triggers a conformational change within the bridge, and this structural reorganization dictates the activity of the adjoining ribozyme. Processes for allosterically selecting other multidomain polynucleotides typically involve mixing and matching domains to optimize binding or other signal response and/or reporter activity.
L'invention concerne des polynucléotides à domaines multiples, sensibles aux agents de signalisations, configurés et construits de manière à comprendre au moins trois domaines pouvant se chevaucher partiellement, entièrement ou pas du tout, à savoir un domaine activateur (catalytique ou rapporteur), un domaine de pontage et un domaine récepteur. Dans une forme d'exécution caractéristique, un agent de signalisation tel qu'un ligand chimique interagit avec le domaine récepteur, ce qui modifie ou influence d'une autre manière le domaine de pontage de telle façon que la fonction d'activation, catalytique ou rapporteuse du domaine d'actionnement est stimulée ou inhibée. Dans certaines formes à ribozymes par exemple, des détecteurs moléculaires spécifiques du ligand, composés d'ARN, sont créés par couplage du domaine catalytique et du domaine récepteur préexistants au moyen de nouveaux ponts structurels fonctionnant de la manière suivante : la fixation d'un ligand sur le domaine récepteur provoque une modification de la configuration du pont et cette réorganisation structurelle détermine l'activité du ribozyme contigu. L'invention concerne également des procédés permettant une sélection allostérique d'autres polynucléotides à domaines multiples, ces procédés consistant normalement à répartir et à coupler les domaines de manière à favoriser la liaison ou d'autres signaux réponse et/ou l'activité rapporteuse.
Breaker Ronald R.
Soukup Garrett A.
Mbm Intellectual Property Law Llp
Yale University
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1812907