C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/574 (2006.01)
Patent
CA 2587817
The present invention provides methods for diagnosis and monitoring the efficacy of treatment of a cancer. More particularly, the methods of the invention comprise detecting an enhanced degree of chromatin modification within Chromosome 2 of the human genome from about map position 2ql4.1 to about map position 2ql4.3 in a sample derived from a subject. The methods include detecting an enhanced level of methylation, or detecting an enhanced level of modification of a histone positioned within the chromatin within the region of about 2ql4.1 to 2ql4.3 of Chromosome 2. The methods also include detecting a modulated level of expression of a gene within the region of about 2ql4.1 to 2ql4.3 of Chromosome 2. The gene may be selected from the group consisting of DEAD box polypeptide 18 (DDXl 8), translin (TSN), v-ral simian leukaemia viral oncogene homolog B (RALB), secretin recepto (SCTR), engrailed homolog 1 (ENl), macrophage receptor with collagenous structure (MARCO), protein tyrosine phosphatase non-receptor type 4 (PTPN4), insulin induced gene 2 (INSIG2), inhibin beta B (INHBB), GLI-Kruppel family member 2 (GLI2), FLJ10996, STEAP3, diazepam binding inhibitor (DBI), MGC10993, erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 (EPB41L5), FLJ14816, transcription factor CP2- like 1 (TFCP2L1).
La présente invention concerne des méthodes de diagnostic d'un cancer et le suivi de l'efficacité du traitement de celui-ci. Plus particulièrement, les méthodes de l'invention consistent à détecter un degré accru de modification de la chromatine au sein du Chromosome 2 du génome humain environ à partir de la position 2ql4.1 à environ la position 2ql4.3 de la carte dans un échantillon dérivé d'un sujet. Les méthodes consistent à détecter un niveau accru de méthylation ou de détecter un niveau accru de modification d'une histone positionnée au sein de la chromatine à l'intérieur de la région allant d'environ 2ql4.1 à 2ql4.3 du Chromosome 2. Les méthodes consistent également à détecter un niveau modulé d'expression d'un gène au sein de la région allant d'environ 2ql4.1 à 2ql4.3 du Chromosome 2. Le gène peut être sélectionné dans le groupe comprenant le polypeptide 18 de la séquence DEAD (DDXl 8), la transline (TSN), l'homologue B de l'oncogène viral de la leucémie du singe v-ral (RALB), le récepteur de la sécrétine (SCTR), l'homologue engrélé 1 (ENl), le récepteur de macrophages ayant une structure collagène (MARCO), la protéine tyrosine phosphatase non-réceptrice de type 4 (PTPN4), le gène induit par l'insuline 2 (INSIG2), l'inhibine bêta B (INHBB), du membre 2 de la famille de GLI-Kruppel (GLI2), FLJ10996, STEAP3, l'inhibiteur de liaison au diazépam (DBI), MGC10993, la bande 5 type 4.1 de protéines membranaires érythrocytaires (EPB41L5), FLJ14816, le facteur de transcription 1 type CP2 (TFCP2L1).
Clark Susan Joy
Mas Jordi Frigola
Peinado Miguel A.
Garvan Institute Of Medical Research
Gowling Lafleur Henderson Llp
LandOfFree
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